235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_2013 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_2013  sodium-calcium exchanger  100 
 
 
322 aa  620  1e-177  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0181  sodium/calcium antiporter family protein  99.69 
 
 
320 aa  614  1e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3625  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  45.6 
 
 
326 aa  251  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1369  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  44.16 
 
 
326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3082  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  43.35 
 
 
320 aa  238  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.17 
 
 
319 aa  235  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3305  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.08 
 
 
319 aa  232  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0287  putative calcium/sodium:proton antiporter  43.13 
 
 
321 aa  232  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  42.06 
 
 
325 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0280  putative calcium/sodium:proton antiporter  43.13 
 
 
321 aa  230  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0495  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.51 
 
 
320 aa  229  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000835013  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.65 
 
 
320 aa  229  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4234  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.31 
 
 
319 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309074 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  43.57 
 
 
323 aa  229  4e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2103  hypothetical protein  42.28 
 
 
332 aa  225  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0549  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  43.95 
 
 
324 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.240591 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  42.14 
 
 
323 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  44.65 
 
 
318 aa  223  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.69 
 
 
323 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.27 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  41.39 
 
 
322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.81 
 
 
324 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.81 
 
 
324 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.81 
 
 
324 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002408  YrbG protein  42.19 
 
 
321 aa  219  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.411327  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2006  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  39.69 
 
 
324 aa  219  5e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3399  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.85 
 
 
325 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1854  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  42.22 
 
 
322 aa  219  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0304514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03659  hypothetical protein  41.86 
 
 
321 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1188  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  42.14 
 
 
325 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  41.67 
 
 
326 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1368  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  44.37 
 
 
324 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.517687  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3371  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  42.27 
 
 
320 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2262  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  41.58 
 
 
328 aa  212  4.9999999999999996e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.436095  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3173  putative sodium/calcium exchanger protein  40.19 
 
 
331 aa  212  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222381  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0509  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  45.03 
 
 
324 aa  210  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3809  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.68 
 
 
320 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112683  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0977  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  40.12 
 
 
329 aa  204  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3291  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.93 
 
 
321 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0788949  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3651  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.29 
 
 
320 aa  202  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2414  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  44.44 
 
 
332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0364  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  42.11 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.174452  normal  0.286588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.06 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0181  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  37.61 
 
 
329 aa  196  3e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00253398  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3632  putative calcium/sodium:proton antiporter  40.07 
 
 
325 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  42 
 
 
310 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.96 
 
 
310 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  38.12 
 
 
358 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3611  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.87 
 
 
325 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.297385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3506  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.87 
 
 
325 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2109  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  39.88 
 
 
322 aa  191  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.125049  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3575  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.87 
 
 
325 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3673  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.56 
 
 
325 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.074393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3504  putative calcium/sodium:proton antiporter  39.56 
 
 
325 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.316714  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07505  sodium/calcium exchanger  41.06 
 
 
316 aa  187  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  38.93 
 
 
307 aa  185  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  38.65 
 
 
367 aa  185  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  38.21 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2920  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.32 
 
 
369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00779404  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  39.12 
 
 
310 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  38.11 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.5 
 
 
316 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.42 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.83 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.83 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.42 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.42 
 
 
314 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  39.73 
 
 
309 aa  178  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.09 
 
 
314 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2404  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  38.51 
 
 
357 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3492  putative calcium/sodium:proton antiporter  37.22 
 
 
325 aa  176  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3684  putative calcium/sodium:proton antiporter  37.22 
 
 
325 aa  175  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4518  putative calcium/sodium:proton antiporter  37.22 
 
 
325 aa  175  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.449826  normal  0.512048 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0511  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.22 
 
 
325 aa  175  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3389  putative calcium/sodium:proton antiporter  37.22 
 
 
325 aa  175  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.126361  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0504  putative calcium/sodium:proton antiporter  37.22 
 
 
325 aa  175  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.18976 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03061  predicted calcium/sodium:proton antiporter  36.89 
 
 
325 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0199282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03012  hypothetical protein  36.89 
 
 
325 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0189866  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3574  putative calcium/sodium:proton antiporter  36.89 
 
 
325 aa  172  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2224  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.78 
 
 
327 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0474  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  37.54 
 
 
367 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3954  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  36.2 
 
 
367 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  37.38 
 
 
368 aa  168  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2520  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  35.9 
 
 
357 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0417  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  33.12 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06321  CaCA family sodium/calcium exchanger  35.76 
 
 
359 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0590  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  33.99 
 
 
296 aa  166  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  34.6 
 
 
357 aa  166  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2386  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.16 
 
 
325 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1369  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  36.13 
 
 
315 aa  165  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0004  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  37.25 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3670  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  34.11 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000078626 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  39.29 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2638  putative sodium/calcium exchanger  39.61 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3503  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.15 
 
 
310 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06231  CaCA family sodium/calcium exchanger  36.93 
 
 
364 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.379015  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18111  CaCA family sodium/calcium exchanger  35.83 
 
 
369 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0941081 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  34.43 
 
 
311 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  36.59 
 
 
322 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1366  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  35.99 
 
 
320 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>