247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0287 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0287  putative calcium/sodium:proton antiporter  100 
 
 
321 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0280  putative calcium/sodium:proton antiporter  97.51 
 
 
321 aa  596  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3809  putative calcium/sodium:proton antiporter  77.57 
 
 
320 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3651  putative calcium/sodium:proton antiporter  77.81 
 
 
320 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  69.18 
 
 
325 aa  434  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  70.53 
 
 
324 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  70.53 
 
 
324 aa  423  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  70.53 
 
 
324 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3673  putative calcium/sodium:proton antiporter  60.44 
 
 
325 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.074393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3504  putative calcium/sodium:proton antiporter  60.44 
 
 
325 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.316714  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3575  putative calcium/sodium:proton antiporter  60.12 
 
 
325 aa  358  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3506  putative calcium/sodium:proton antiporter  60.12 
 
 
325 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3611  putative calcium/sodium:proton antiporter  60.12 
 
 
325 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.297385 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3632  putative calcium/sodium:proton antiporter  57.63 
 
 
325 aa  339  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2103  hypothetical protein  52.85 
 
 
332 aa  333  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0511  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  59.81 
 
 
325 aa  329  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0504  putative calcium/sodium:proton antiporter  59.81 
 
 
325 aa  329  3e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.18976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3492  putative calcium/sodium:proton antiporter  59.81 
 
 
325 aa  330  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3389  putative calcium/sodium:proton antiporter  59.81 
 
 
325 aa  329  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.126361  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4518  putative calcium/sodium:proton antiporter  59.81 
 
 
325 aa  330  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.449826  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3684  putative calcium/sodium:proton antiporter  59.81 
 
 
325 aa  330  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.187943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3574  putative calcium/sodium:proton antiporter  59.81 
 
 
325 aa  328  6e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03061  predicted calcium/sodium:proton antiporter  59.5 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0199282  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03012  hypothetical protein  59.5 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0189866  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002408  YrbG protein  50.82 
 
 
321 aa  310  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.411327  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03659  hypothetical protein  50.82 
 
 
321 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0504  sodium/calcium exchanger protein  49.67 
 
 
322 aa  296  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0495  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  48.14 
 
 
320 aa  287  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000835013  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  47.7 
 
 
320 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4234  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  45.31 
 
 
319 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000309074 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3082  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  45 
 
 
320 aa  276  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  45.62 
 
 
319 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3305  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  46.58 
 
 
319 aa  273  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3371  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  45.62 
 
 
320 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  45 
 
 
319 aa  270  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  45.94 
 
 
318 aa  266  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4537  putative sodium/calcium exchanger protein  44.14 
 
 
326 aa  257  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3625  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  43.79 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3173  putative sodium/calcium exchanger protein  40.25 
 
 
331 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.222381  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1962  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  42.43 
 
 
323 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3399  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.9 
 
 
325 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.95 
 
 
367 aa  229  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.09 
 
 
364 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1078  sodium/calcium exchange protein  42.95 
 
 
323 aa  228  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1369  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.43 
 
 
326 aa  227  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0468574  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0181  sodium/calcium antiporter family protein  41.88 
 
 
320 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2013  sodium-calcium exchanger  41.88 
 
 
322 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1854  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  43.61 
 
 
322 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0304514  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0732  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.44 
 
 
323 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0549  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  43.08 
 
 
324 aa  222  6e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.240591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2006  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  42.54 
 
 
324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0977  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  40.19 
 
 
329 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2262  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  46.2 
 
 
328 aa  212  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.436095  normal  0.508366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3954  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.99 
 
 
367 aa  212  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2920  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  43.61 
 
 
369 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00779404  normal  0.479363 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0364  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  42.45 
 
 
325 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.174452  normal  0.286588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2414  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.68 
 
 
332 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1368  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.52 
 
 
324 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.517687  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1188  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  40.54 
 
 
325 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354687  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.14 
 
 
307 aa  209  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.18 
 
 
316 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.18 
 
 
316 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.18 
 
 
316 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0181  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  36.99 
 
 
329 aa  206  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00253398  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  43.18 
 
 
316 aa  206  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.21 
 
 
316 aa  206  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12590  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  43.44 
 
 
368 aa  205  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.483564  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.73 
 
 
310 aa  205  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2520  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  38.32 
 
 
357 aa  202  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.38 
 
 
357 aa  202  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.13 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1295  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  43.13 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.13 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  40.13 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  39.37 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  40.13 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.45 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3291  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.86 
 
 
321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0788949  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2638  putative sodium/calcium exchanger  42.04 
 
 
305 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.679614  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2404  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.2 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0741  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.34 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000278551  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  42.21 
 
 
310 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2386  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  42.19 
 
 
325 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1366  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  38.24 
 
 
320 aa  194  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4058  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  40.25 
 
 
319 aa  193  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2522  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  37.86 
 
 
314 aa  192  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2279  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.31 
 
 
350 aa  192  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  39.12 
 
 
309 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0509  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  40.86 
 
 
324 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1539  inner membrane protein  43.83 
 
 
318 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.544691  normal  0.292097 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0194  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  37.3 
 
 
320 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.163392  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0272  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  41.04 
 
 
358 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0474  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  39.33 
 
 
367 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0778  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  38.56 
 
 
329 aa  189  7e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.020554  normal  0.0984265 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0242  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  41.04 
 
 
369 aa  188  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217484  normal  0.542951 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2224  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  41.25 
 
 
327 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0928  hypothetical protein  38.91 
 
 
319 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0958  hypothetical protein  38.59 
 
 
319 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3921  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  37.79 
 
 
316 aa  186  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2577  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  41.12 
 
 
320 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>