68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0633 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0633  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 406 aa  811    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1109  sodium/calcium exchanger membrane region  73.33 
 
 		 408 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0594  sodium/calcium exchanger membrane region  61.58 
 
 		 406 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000257465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3015  sodium/calcium exchanger membrane region  42.69 
 
 		 443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.74257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1879  sodium/calcium exchanger membrane region  50.78 
 
 		 428 aa  272  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.335578  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2287  sodium/calcium exchanger membrane region  42.75 
 
 		 440 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27910  Ca2+/Na+ antiporter  43.81 
 
 		 452 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.629726  normal  0.0279319 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6755  sodium/calcium exchanger membrane region  43.68 
 
 		 412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0637  sodium/calcium exchanger membrane region  50.74 
 
 		 397 aa  259  7e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2005  sodium/calcium exchanger membrane region  36.78 
 
 		 462 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2933  sodium/calcium exchanger membrane region  36.19 
 
 		 452 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00262618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1901  sodium/calcium exchanger membrane region  40.06 
 
 		 436 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0545835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2477  sodium/calcium exchanger membrane region  39.11 
 
 		 448 aa  226  7e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.55 
 
 		 316 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.55 
 
 		 316 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.24 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.04 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.04 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.04 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  27.04 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.84 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0417  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  27.65 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  24.21 
 
 		 316 aa  62.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.47 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2404  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.02 
 
 		 357 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.81 
 
 		 307 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  25.93 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0511  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.76 
 
 		 324 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1147  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.76 
 
 		 324 aa  54.7  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0447  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.76 
 
 		 324 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.597372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4361  putative calcium/sodium:proton antiporter  24.6 
 
 		 325 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.17672  normal  0.104496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.12 
 
 		 310 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2140  sodium/calcium exchanger membrane region  28.63 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.6071  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.39 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06231  CaCA family sodium/calcium exchanger  25.98 
 
 		 364 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.379015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  29.75 
 
 		 316 aa  50.4  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0004  putative CaCA family sodium/calcium exchanger  25.2 
 
 		 364 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.62 
 
 		 311 aa  48.9  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05721  CaCA family sodium/calcium exchanger  26.47 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.269845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  35.53 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.26 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0203  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.73 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.42407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0205  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.73 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.638827  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  25.37 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2051  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.82 
 
 		 324 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3503  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  26.91 
 
 		 310 aa  47.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0831  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  21.59 
 
 		 314 aa  47.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00973668  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5095  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.23 
 
 		 325 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.200539  normal  0.310038 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  28.35 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03187  sodium-calcium exchanger  24.69 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  28.79 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  28.35 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  26.4 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  28.35 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0097  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.27 
 
 		 334 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.625473  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2093  sodium/calcium exchanger protein  26.86 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5993  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.27 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0950  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.54 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4058  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  22.56 
 
 		 319 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1539  inner membrane protein  29.46 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.544691  normal  0.292097 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0189  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.32 
 
 		 334 aa  44.3  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1963  sodium/calcium exchanger membrane region  29.6 
 
 		 343 aa  43.9  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.520239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.91 
 
 		 357 aa  43.9  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1536  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.57 
 
 		 331 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1817  calcium/proton exchanger  25 
 
 		 331 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.378438  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0128  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.81 
 
 		 330 aa  43.1  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000573461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  24.79 
 
 		 328 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>