18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2005 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2005  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 462 aa  901    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2933  sodium/calcium exchanger membrane region  62.27 
 
 		 452 aa  510  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00262618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2477  sodium/calcium exchanger membrane region  62.67 
 
 		 448 aa  500  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1901  sodium/calcium exchanger membrane region  60.54 
 
 		 436 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0545835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3015  sodium/calcium exchanger membrane region  39.8 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.74257  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1109  sodium/calcium exchanger membrane region  38.62 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27910  Ca2+/Na+ antiporter  39.61 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.629726  normal  0.0279319 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0633  sodium/calcium exchanger membrane region  36.78 
 
 		 406 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0594  sodium/calcium exchanger membrane region  39.44 
 
 		 406 aa  229  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000257465  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6755  sodium/calcium exchanger membrane region  36.45 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2287  sodium/calcium exchanger membrane region  37.18 
 
 		 440 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0637  sodium/calcium exchanger membrane region  40.27 
 
 		 397 aa  200  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1879  sodium/calcium exchanger membrane region  35.92 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.335578  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  25.58 
 
 		 336 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  25.58 
 
 		 336 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  25.58 
 
 		 336 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  25 
 
 		 336 aa  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  25 
 
 		 336 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>