16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6755 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6755  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 412 aa  815    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1879  sodium/calcium exchanger membrane region  65.65 
 
 		 428 aa  480  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.335578  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2287  sodium/calcium exchanger membrane region  63.68 
 
 		 440 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1109  sodium/calcium exchanger membrane region  43.68 
 
 		 408 aa  269  8e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0633  sodium/calcium exchanger membrane region  43.97 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0637  sodium/calcium exchanger membrane region  49.52 
 
 		 397 aa  259  6e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0594  sodium/calcium exchanger membrane region  38.89 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000257465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3015  sodium/calcium exchanger membrane region  40.47 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.74257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2005  sodium/calcium exchanger membrane region  36.7 
 
 		 462 aa  223  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1901  sodium/calcium exchanger membrane region  38.85 
 
 		 436 aa  222  9e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0545835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2477  sodium/calcium exchanger membrane region  36.95 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27910  Ca2+/Na+ antiporter  36.5 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.629726  normal  0.0279319 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2933  sodium/calcium exchanger membrane region  36.22 
 
 		 452 aa  204  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00262618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.31 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0097  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  31.51 
 
 		 334 aa  47.8  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.625473  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4588  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  21.72 
 
 		 310 aa  43.1  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.902154  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>