27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2477 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2477  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 448 aa  882    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2005  sodium/calcium exchanger membrane region  62.67 
 
 		 462 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2933  sodium/calcium exchanger membrane region  62.15 
 
 		 452 aa  509  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00262618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1901  sodium/calcium exchanger membrane region  61.64 
 
 		 436 aa  486  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0545835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0633  sodium/calcium exchanger membrane region  39.11 
 
 		 406 aa  239  8e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3015  sodium/calcium exchanger membrane region  38.58 
 
 		 443 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.74257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27910  Ca2+/Na+ antiporter  37.77 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.629726  normal  0.0279319 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1109  sodium/calcium exchanger membrane region  36.69 
 
 		 408 aa  230  4e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0594  sodium/calcium exchanger membrane region  38.27 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000257465  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6755  sodium/calcium exchanger membrane region  36.95 
 
 		 412 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1879  sodium/calcium exchanger membrane region  37.23 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.335578  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2287  sodium/calcium exchanger membrane region  36.13 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0637  sodium/calcium exchanger membrane region  39.1 
 
 		 397 aa  186  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  26.74 
 
 		 336 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  26.74 
 
 		 336 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  26.74 
 
 		 336 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  24.19 
 
 		 336 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.41 
 
 		 316 aa  47  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.89 
 
 		 314 aa  46.6  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.89 
 
 		 314 aa  46.6  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.89 
 
 		 314 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.89 
 
 		 314 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  24.93 
 
 		 316 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.65 
 
 		 310 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  24.19 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  20.83 
 
 		 336 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  24.34 
 
 		 333 aa  43.1  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>