22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1901 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1901  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 436 aa  854    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0545835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2477  sodium/calcium exchanger membrane region  62.56 
 
 		 448 aa  503  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2005  sodium/calcium exchanger membrane region  61.68 
 
 		 462 aa  497  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2933  sodium/calcium exchanger membrane region  61.58 
 
 		 452 aa  487  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00262618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27910  Ca2+/Na+ antiporter  39.25 
 
 		 452 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.629726  normal  0.0279319 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0633  sodium/calcium exchanger membrane region  40.91 
 
 		 406 aa  246  8e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3015  sodium/calcium exchanger membrane region  38.22 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.74257  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1109  sodium/calcium exchanger membrane region  37.44 
 
 		 408 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0594  sodium/calcium exchanger membrane region  38.32 
 
 		 406 aa  236  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000257465  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6755  sodium/calcium exchanger membrane region  38.21 
 
 		 412 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1879  sodium/calcium exchanger membrane region  38.11 
 
 		 428 aa  209  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.335578  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2287  sodium/calcium exchanger membrane region  38.9 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0637  sodium/calcium exchanger membrane region  38.4 
 
 		 397 aa  200  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  28.97 
 
 		 333 aa  51.6  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  22.16 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  22.16 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  24.23 
 
 		 309 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  22.16 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  24.32 
 
 		 336 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  20.45 
 
 		 336 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.94 
 
 		 310 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.19 
 
 		 316 aa  43.5  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>