50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0594 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0594  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 406 aa  808    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000257465  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1109  sodium/calcium exchanger membrane region  62.78 
 
 		 408 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0633  sodium/calcium exchanger membrane region  61.58 
 
 		 406 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3015  sodium/calcium exchanger membrane region  43.5 
 
 		 443 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.74257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2005  sodium/calcium exchanger membrane region  40.46 
 
 		 462 aa  262  8e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27910  Ca2+/Na+ antiporter  40.42 
 
 		 452 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.629726  normal  0.0279319 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1901  sodium/calcium exchanger membrane region  38.08 
 
 		 436 aa  251  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0545835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2477  sodium/calcium exchanger membrane region  39.26 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6755  sodium/calcium exchanger membrane region  39.8 
 
 		 412 aa  247  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1879  sodium/calcium exchanger membrane region  44.92 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.335578  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2287  sodium/calcium exchanger membrane region  40.66 
 
 		 440 aa  239  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2933  sodium/calcium exchanger membrane region  38.18 
 
 		 452 aa  237  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00262618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0637  sodium/calcium exchanger membrane region  48.17 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0348  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.78 
 
 		 314 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0355  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.41 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000157551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0358  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  27.41 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561801  decreased coverage  0.00000000752949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0350  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  27.41 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.25399  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0189  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.55 
 
 		 334 aa  53.9  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3635  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.72 
 
 		 316 aa  53.5  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000393256  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0417  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  26.62 
 
 		 314 aa  53.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0325  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.04 
 
 		 316 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3618  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.04 
 
 		 316 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3404  sodium/calcium exchanger membrane region  28.3 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4763  sodium/calcium exchanger membrane region  28.3 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0790381  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4112  sodium/calcium exchanger membrane region  28.3 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3291  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  31.3 
 
 		 321 aa  50.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0788949  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3815  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.04 
 
 		 316 aa  50.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  29.13 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0360  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family protein  22.78 
 
 		 309 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0330  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.7 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0502313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3399  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  38.57 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4058  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.62 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1072  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.34 
 
 		 308 aa  48.9  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.301699  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0950  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.3 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  24.92 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3438  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  21.97 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.852406  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2404  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  24.28 
 
 		 357 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  28.35 
 
 		 336 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.62 
 
 		 358 aa  46.6  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0106  sodium/calcium exchanger membrane region  23.24 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000029721  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.1 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3503  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.11 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.71 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0562  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.54 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0977  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  23.38 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  25.81 
 
 		 316 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1854  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  29.11 
 
 		 322 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0304514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1116  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.26 
 
 		 367 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.47681  normal  0.852669 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  26.85 
 
 		 334 aa  43.9  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0851  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.33 
 
 		 364 aa  43.1  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>