20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1540 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1540  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 305 aa  582  1.0000000000000001e-165  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.494574  normal  0.0390081 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2140  sodium/calcium exchanger membrane region  43.06 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.6071  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0931  sodium/calcium exchanger membrane region  37.58 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3344  sodium/calcium exchanger membrane region  27.62 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.510266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  26.64 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4366  sodium/calcium exchanger membrane region  28.63 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0417  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  25.4 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0587  sodium/calcium exchanger  25.75 
 
 		 335 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.229612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2364  sodium/calcium exchanger membrane region  26.45 
 
 		 335 aa  53.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000667432  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0739  sodium/calcium exchanger membrane region  25.75 
 
 		 316 aa  52.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000114246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3173  sodium/calcium exchanger membrane region  25.51 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2521  sodium/calcium exchanger membrane region  27.9 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3053  sodium/calcium exchanger membrane region  27.35 
 
 		 338 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0818  Sodium/calcium exchanger membrane region  27.92 
 
 		 334 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000151799  hitchhiker  0.00227124 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0654  sodium/calcium exchanger membrane region  23.68 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000139213  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0303  hypothetical protein  23.38 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.667195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2086  sodium/calcium exchanger membrane region  23.01 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1471  sodium/calcium exchanger membrane region  25.94 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4058  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.62 
 
 		 319 aa  42.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2556  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  24.62 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00317334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>