12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0303 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0303  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  627  1e-179  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.667195  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2140  sodium/calcium exchanger membrane region  21.45 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.6071  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0931  sodium/calcium exchanger membrane region  27.31 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3883  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.83 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.150856  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3610  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  24.11 
 
 		 319 aa  46.2  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3305  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  23.33 
 
 		 319 aa  45.8  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0890  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  21.62 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000303038  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4234  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  22.32 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000309074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3841  Na+/Ca+ antiporter, CaCA family  23.64 
 
 		 357 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0354  sodium/calcium exchanger  23.19 
 
 		 316 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0495  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  22.12 
 
 		 320 aa  42.7  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000835013  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1577  CaCA family Na(+)/Ca(+) antiporter  25.33 
 
 		 311 aa  42.7  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00101794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>