98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2437 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2437  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  100 
 
 		 179 aa  359  1e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.719613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0772  cyclic nucleotide-binding protein  26.95 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  25.48 
 
 		 409 aa  54.3  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  24.38 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2085  cyclic nucleotide binding protein  29.58 
 
 		 238 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.36 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2556  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.82 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1521  cyclic nucleotide-binding protein  34.13 
 
 		 153 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000183504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  23.62 
 
 		 407 aa  52  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 234 aa  52  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  28.79 
 
 		 322 aa  51.6  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  26 
 
 		 230 aa  50.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.11 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3910  cyclic nucleotide-binding protein  34.55 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.34683  normal  0.175845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2246  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  27.19 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00758  putative transcriptional regulator (Crp family) protein  27.05 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5778  cyclic nucleotide-binding protein  21.99 
 
 		 353 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.714206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  29.66 
 
 		 577 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3025  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  24.49 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  27.5 
 
 		 357 aa  48.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 226 aa  47.8  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3189  transcriptional regulator  24.79 
 
 		 236 aa  47.8  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2020  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.93 
 
 		 239 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0424227  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0611  hypothetical protein  26.61 
 
 		 738 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3727  cyclic nucleotide-binding protein  33.94 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.13 
 
 		 227 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1398  cyclic nucleotide-binding protein  25.86 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 234 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3151  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.64 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355427  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 227 aa  45.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.23 
 
 		 231 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  26.72 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3150  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 252 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.88 
 
 		 225 aa  45.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 232 aa  45.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4550  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.71 
 
 		 238 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1612  cyclic nucleotide-binding protein  31.4 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.88 
 
 		 251 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  23.01 
 
 		 267 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.23 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1517  cyclic nucleotide-binding protein  31.4 
 
 		 154 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2645  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 123 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597241 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  27.78 
 
 		 217 aa  44.7  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0335  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 175 aa  44.3  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.799233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  26.21 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.5 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  29.57 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2391  cyclic nucleotide-binding protein  27.74 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  24.64 
 
 		 857 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0998  cyclic nucleotide-binding protein  24.56 
 
 		 265 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222196  unclonable  1.0277600000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  25.86 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.42 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  26.92 
 
 		 495 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  26.24 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.52 
 
 		 229 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.26 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62260  hypothetical protein  24.56 
 
 		 265 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000560596  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2621  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.61 
 
 		 467 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167094  decreased coverage  0.0008696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  20.8 
 
 		 435 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  26.47 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.49 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5420  hypothetical protein  24.56 
 
 		 265 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00117771  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1292  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.11 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  25 
 
 		 352 aa  42.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.71 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  23.62 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  24.79 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 254 aa  42  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.35 
 
 		 230 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4053  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2352  cyclic nucleotide-binding protein  30.58 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674498  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  24.79 
 
 		 482 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1298  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  21.54 
 
 		 177 aa  42  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000825589  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 221 aa  42  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.607183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 228 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  23.73 
 
 		 261 aa  42  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.4 
 
 		 408 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 948 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 225 aa  41.6  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 226 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  25.9 
 
 		 214 aa  41.2  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.89 
 
 		 235 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.89 
 
 		 235 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2478  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 249 aa  40.8  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0642  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24 
 
 		 231 aa  40.8  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>