More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1317 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  100 
 
 		 170 aa  332  2e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  72.89 
 
 		 168 aa  249  9.000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  46.3 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  45.16 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  47.22 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  41.77 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  41.77 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  44.52 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  40.51 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  44.81 
 
 		 161 aa  134  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  45.51 
 
 		 157 aa  134  9e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  43.05 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  43.75 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  43.95 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  39.24 
 
 		 159 aa  131  5e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  43.23 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  41.94 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  40.91 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  40.24 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  44.44 
 
 		 159 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  37.66 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1602  50S ribosomal protein L11P  39.76 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.951942 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  39.61 
 
 		 162 aa  119  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  39.61 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0464  50S ribosomal protein L11P  37.72 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1832  50S ribosomal protein L11P  35.54 
 
 		 166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0676  ribosomal protein L11  38.46 
 
 		 169 aa  110  8.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1656  50S ribosomal protein L11P  34.13 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  40.74 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  40.3 
 
 		 141 aa  95.1  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  38.81 
 
 		 141 aa  94.7  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  37.78 
 
 		 140 aa  94  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  37.59 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  37.78 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 144 aa  92.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  38.46 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  37.59 
 
 		 144 aa  91.7  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  36.84 
 
 		 142 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  36.3 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  36.84 
 
 		 142 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  36.84 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  35.92 
 
 		 146 aa  89  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  36.84 
 
 		 142 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  38.81 
 
 		 143 aa  89  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  36.84 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 144 aa  88.6  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  34.31 
 
 		 145 aa  87.8  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4773  50S ribosomal protein L11  38.52 
 
 		 142 aa  87.8  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0832253  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0315  50S ribosomal protein L11  38.81 
 
 		 142 aa  87.8  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0486  50S ribosomal protein L11  38.81 
 
 		 142 aa  87.8  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0527955  hitchhiker  0.00000142246 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  37.96 
 
 		 141 aa  87.4  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  38.06 
 
 		 143 aa  87.4  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  39.39 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  37.88 
 
 		 141 aa  87  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  38.06 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0745  50S ribosomal protein L11  40.3 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00286512  normal  0.949117 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0173  50S ribosomal protein L11  37.78 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4701  50S ribosomal protein L11  37.78 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000419074  hitchhiker  0.00000427936 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 141 aa  86.3  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  36.3 
 
 		 140 aa  86.7  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  37.59 
 
 		 140 aa  86.7  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 141 aa  85.5  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  38.06 
 
 		 148 aa  85.9  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  34.33 
 
 		 141 aa  85.1  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  32.85 
 
 		 141 aa  85.1  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0147  50S ribosomal protein L11  37.04 
 
 		 142 aa  84.7  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000977469  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  36.84 
 
 		 142 aa  84.7  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  34.53 
 
 		 149 aa  84.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  37.88 
 
 		 141 aa  84.7  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  84.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  84.3  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  33.33 
 
 		 145 aa  84.3  6e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  34.53 
 
 		 147 aa  84.7  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  33.33 
 
 		 142 aa  84.3  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  34.33 
 
 		 145 aa  84.3  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  34.56 
 
 		 141 aa  84.3  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4328  50S ribosomal protein L11  37.04 
 
 		 142 aa  84.3  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000353515  hitchhiker  0.00000000170841 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0312  ribosomal protein L11  35.82 
 
 		 143 aa  84.3  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000294677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  84.3  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  37.69 
 
 		 144 aa  84.3  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  35.82 
 
 		 143 aa  84.3  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  35.56 
 
 		 141 aa  84  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  34.33 
 
 		 143 aa  84  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  32.12 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  32.12 
 
 		 141 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  37.31 
 
 		 143 aa  84  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3735  ribosomal protein L11  36.3 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257354  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  36.84 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0755  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  34.53 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0137  50S ribosomal protein L11  36.3 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000238493  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  33.82 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  35.61 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  35.82 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  35.82 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0422  50S ribosomal protein L11  33.09 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000957396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>