More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1104 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  100 
 
 		 146 aa  297  3e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  66.42 
 
 		 143 aa  193  8.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 147 aa  191  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0422  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 145 aa  190  6e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000957396  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 147 aa  190  6e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 141 aa  189  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 140 aa  189  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 140 aa  189  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1706  ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 147 aa  188  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 142 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 149 aa  187  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 143 aa  185  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 142 aa  184  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00045  50S ribosomal protein L11  60.99 
 
 		 146 aa  184  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 147 aa  184  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 144 aa  184  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 141 aa  183  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 141 aa  183  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  62.59 
 
 		 143 aa  183  7e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 140 aa  183  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1400  hypothetical protein  59.29 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  61.7 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  63.31 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  64.08 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  63.31 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 141 aa  180  7e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  64.49 
 
 		 145 aa  180  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  60.71 
 
 		 141 aa  180  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 143 aa  179  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0170  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0415128  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1667  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00198224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0177  50S ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0566488  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0315  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000425279  hitchhiker  0.000807121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0524  50S ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0672587  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  64.08 
 
 		 143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0505  50S ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399461  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  64.08 
 
 		 143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1460  50S ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000504734  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0445  50S ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 141 aa  177  4.999999999999999e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00177755  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 141 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 141 aa  176  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1320  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800207  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0390  50S ribosomal protein L11  58.87 
 
 		 145 aa  176  8e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0826  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08720  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444282  hitchhiker  0.00204472 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3735  ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>