More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5964 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
143 aa  289  7e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  79.58 
 
 
142 aa  236  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  79.58 
 
 
142 aa  236  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  79.58 
 
 
142 aa  234  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  79.58 
 
 
142 aa  234  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4329  50S ribosomal protein L11  80.14 
 
 
143 aa  233  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  76.76 
 
 
142 aa  233  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3937  50S ribosomal protein L11  80.14 
 
 
143 aa  233  7e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  79.58 
 
 
142 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  78.87 
 
 
142 aa  231  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  80.58 
 
 
144 aa  230  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  76.09 
 
 
144 aa  227  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  78.42 
 
 
143 aa  224  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  73.94 
 
 
143 aa  224  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  73.94 
 
 
143 aa  223  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  74.47 
 
 
144 aa  223  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  70.92 
 
 
143 aa  222  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  73.94 
 
 
143 aa  221  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  79.14 
 
 
144 aa  220  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  73.05 
 
 
143 aa  221  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  71.83 
 
 
143 aa  219  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  73.94 
 
 
143 aa  219  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  71.13 
 
 
142 aa  218  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  75.36 
 
 
144 aa  216  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  73.94 
 
 
143 aa  216  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  70.92 
 
 
143 aa  215  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  71.83 
 
 
143 aa  215  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  71.83 
 
 
143 aa  215  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  72.54 
 
 
143 aa  213  5.9999999999999996e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  79.84 
 
 
143 aa  212  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  75.97 
 
 
144 aa  211  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
143 aa  210  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  67.61 
 
 
142 aa  208  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  69.01 
 
 
142 aa  205  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  67.15 
 
 
141 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  67.61 
 
 
142 aa  206  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  69.34 
 
 
141 aa  204  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  71.22 
 
 
142 aa  203  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  68.61 
 
 
141 aa  202  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
143 aa  201  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  65.94 
 
 
141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  65.94 
 
 
141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  65.94 
 
 
141 aa  196  9e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  65.94 
 
 
141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  66.67 
 
 
140 aa  192  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209a  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 
143 aa  192  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  68.12 
 
 
140 aa  192  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 
141 aa  191  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  62.77 
 
 
141 aa  191  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  64.96 
 
 
140 aa  190  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  67.39 
 
 
141 aa  190  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  67.15 
 
 
141 aa  190  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  65.94 
 
 
141 aa  190  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  67.15 
 
 
141 aa  189  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  63.77 
 
 
141 aa  188  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  68.12 
 
 
140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 
140 aa  186  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 
140 aa  186  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  62.77 
 
 
142 aa  185  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 
140 aa  184  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1623  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 
143 aa  184  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.838498  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 
148 aa  183  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 
141 aa  183  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 
142 aa  183  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 
141 aa  182  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  62.32 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  64.75 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 
141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 
142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  64.39 
 
 
140 aa  181  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  66.91 
 
 
143 aa  181  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  61.59 
 
 
141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  63.77 
 
 
141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 
141 aa  180  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  61.87 
 
 
142 aa  180  6e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  63.04 
 
 
140 aa  180  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 
141 aa  180  8.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  62.32 
 
 
146 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 
141 aa  179  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  65.15 
 
 
140 aa  179  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 
141 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  65.89 
 
 
141 aa  179  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 
141 aa  179  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 
141 aa  179  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 
141 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 
142 aa  178  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 
142 aa  178  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 
141 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 
141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  62.04 
 
 
141 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  63.64 
 
 
140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  57.97 
 
 
141 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  63.77 
 
 
145 aa  177  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 
164 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  60.87 
 
 
140 aa  177  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 
141 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 
141 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 
141 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 
141 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>