More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0443 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  90.71 
 
 
140 aa  263  5e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  85 
 
 
140 aa  245  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  81.43 
 
 
140 aa  233  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  78.57 
 
 
141 aa  231  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  75 
 
 
140 aa  216  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  74.29 
 
 
140 aa  216  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  76.98 
 
 
140 aa  214  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  71.94 
 
 
141 aa  209  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  75 
 
 
140 aa  207  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  73.05 
 
 
143 aa  203  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  70.71 
 
 
141 aa  203  7e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  71.22 
 
 
140 aa  200  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 
140 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 
141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
141 aa  197  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 
141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  70.5 
 
 
141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  70.71 
 
 
141 aa  197  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
141 aa  197  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
141 aa  197  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  70.5 
 
 
141 aa  196  7e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 
140 aa  196  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  66.91 
 
 
141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  70.21 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
140 aa  194  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
140 aa  194  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 
141 aa  194  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
142 aa  194  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 
141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 
141 aa  194  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  70.71 
 
 
140 aa  194  5.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 
141 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  64.75 
 
 
141 aa  193  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 
143 aa  193  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
141 aa  192  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 
141 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 
141 aa  191  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 
141 aa  192  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 
141 aa  192  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 
141 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 
141 aa  192  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 
141 aa  192  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 
141 aa  192  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 
141 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 
141 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 
141 aa  192  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 
141 aa  192  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  68.35 
 
 
142 aa  191  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 
140 aa  191  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 
143 aa  191  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002169  LSU ribosomal protein L11p (L12e)  68.09 
 
 
142 aa  191  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  68.09 
 
 
143 aa  191  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 
141 aa  191  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 
142 aa  191  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 
143 aa  191  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
140 aa  191  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
140 aa  191  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  67.14 
 
 
141 aa  191  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  68.79 
 
 
142 aa  190  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2870  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
142 aa  189  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000138901  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00229  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
142 aa  190  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
143 aa  189  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
143 aa  189  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
143 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
143 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
143 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 
143 aa  189  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
143 aa  189  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
143 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
143 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 
143 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 
143 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
143 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
143 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 
143 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  68.09 
 
 
143 aa  188  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4773  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 
142 aa  188  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0832253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
143 aa  188  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 
141 aa  188  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 
141 aa  188  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
143 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 
141 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 
141 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 
141 aa  188  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0192  50S ribosomal protein L11  72.14 
 
 
141 aa  188  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000446828  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
143 aa  187  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 
143 aa  187  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
141 aa  187  4e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 
141 aa  187  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 
142 aa  186  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1966  50S ribosomal protein L11  72.86 
 
 
141 aa  186  8e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42861  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 
143 aa  186  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 
164 aa  186  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 
141 aa  186  9e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0394  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
143 aa  186  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904146  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  65.96 
 
 
143 aa  186  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 
143 aa  186  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 
148 aa  186  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>