More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1945 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  100 
 
 
161 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  75.16 
 
 
161 aa  256  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  62.34 
 
 
160 aa  196  7.999999999999999e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  61.94 
 
 
159 aa  189  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  61.94 
 
 
159 aa  189  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  56.33 
 
 
158 aa  189  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  58.23 
 
 
158 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  59.35 
 
 
159 aa  184  5e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  62.84 
 
 
158 aa  183  9e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  55.77 
 
 
157 aa  180  7e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  55.77 
 
 
158 aa  179  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  58.71 
 
 
159 aa  179  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  55.62 
 
 
159 aa  178  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  57.69 
 
 
158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  50.64 
 
 
157 aa  164  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  49.36 
 
 
162 aa  161  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  50.64 
 
 
158 aa  159  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  50 
 
 
162 aa  158  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  48.72 
 
 
162 aa  154  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  50.33 
 
 
159 aa  153  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  53.33 
 
 
168 aa  143  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  44.81 
 
 
170 aa  134  7.000000000000001e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  36.88 
 
 
168 aa  113  7.999999999999999e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  45.31 
 
 
140 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  44.53 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  40.3 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  43.07 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0439  ribosomal protein L11  41.48 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  42.64 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  42.96 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  43.07 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  41.09 
 
 
145 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  42.22 
 
 
141 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  40.6 
 
 
142 aa  107  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  42.34 
 
 
141 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  41.78 
 
 
163 aa  106  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  43.31 
 
 
141 aa  105  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  43.97 
 
 
141 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  42.54 
 
 
141 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  41.48 
 
 
141 aa  104  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  41.79 
 
 
141 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  41.79 
 
 
141 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  42.19 
 
 
140 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  38.97 
 
 
141 aa  104  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02801  50S ribosomal protein L11  42.55 
 
 
141 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.219734  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  40.44 
 
 
144 aa  103  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  41.48 
 
 
141 aa  103  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  42.55 
 
 
141 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  42.96 
 
 
141 aa  103  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  38.97 
 
 
144 aa  104  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  42.86 
 
 
141 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  42.64 
 
 
141 aa  103  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 
141 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  40.56 
 
 
143 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  41.13 
 
 
141 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  40.74 
 
 
141 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  41.86 
 
 
141 aa  103  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  42.22 
 
 
141 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  41.04 
 
 
141 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  43.41 
 
 
141 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  39.86 
 
 
147 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  41.13 
 
 
141 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  39.26 
 
 
141 aa  102  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  40.74 
 
 
142 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  42.97 
 
 
143 aa  101  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  39.42 
 
 
141 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  42.96 
 
 
141 aa  101  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  41.22 
 
 
143 aa  101  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  38.24 
 
 
143 aa  101  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 
141 aa  101  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  39.1 
 
 
140 aa  100  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  40.62 
 
 
140 aa  100  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2425  50S ribosomal protein L11  44.19 
 
 
143 aa  100  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0323848  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  40.44 
 
 
143 aa  100  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  40.91 
 
 
140 aa  100  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  41.18 
 
 
144 aa  100  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  41.73 
 
 
141 aa  100  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  41.73 
 
 
141 aa  100  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  41.48 
 
 
144 aa  100  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2724  ribosomal protein L11  43.75 
 
 
143 aa  100  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.239254  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  40.44 
 
 
141 aa  100  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  38.13 
 
 
148 aa  100  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  41.35 
 
 
140 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  40.91 
 
 
141 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  39.85 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  41.04 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  41.04 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  41.04 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  41.04 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  38.97 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  41.04 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  41.04 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  41.04 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  41.04 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  42.42 
 
 
142 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  41.04 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  41.04 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  41.04 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  41.35 
 
 
140 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  40.62 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>