More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1112 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  100 
 
 		 144 aa  290  5e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  90.91 
 
 		 143 aa  265  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  86.11 
 
 		 144 aa  251  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  88.11 
 
 		 142 aa  251  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  88.49 
 
 		 142 aa  249  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  88.49 
 
 		 142 aa  249  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  87.77 
 
 		 142 aa  246  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  86.71 
 
 		 142 aa  246  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  88.81 
 
 		 143 aa  239  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  84.89 
 
 		 142 aa  239  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  80.99 
 
 		 144 aa  235  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  79.72 
 
 		 143 aa  231  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  78.87 
 
 		 143 aa  229  9e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  77.62 
 
 		 142 aa  228  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  78.57 
 
 		 143 aa  224  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  77.08 
 
 		 143 aa  223  6e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  75.52 
 
 		 143 aa  222  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  77.14 
 
 		 143 aa  221  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  76.39 
 
 		 143 aa  221  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  76.76 
 
 		 143 aa  221  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  77.14 
 
 		 143 aa  221  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  79.14 
 
 		 143 aa  220  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  76.76 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  72.54 
 
 		 143 aa  213  9e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  72.03 
 
 		 142 aa  212  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  72.73 
 
 		 142 aa  211  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  74.65 
 
 		 144 aa  210  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4329  50S ribosomal protein L11  72.54 
 
 		 143 aa  210  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3937  50S ribosomal protein L11  72.54 
 
 		 143 aa  210  5.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  73.57 
 
 		 143 aa  207  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  76.76 
 
 		 144 aa  206  6e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  72.86 
 
 		 143 aa  206  7e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  69.72 
 
 		 143 aa  206  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  69.93 
 
 		 142 aa  202  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  68.53 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 148 aa  197  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  68.61 
 
 		 141 aa  196  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  68.12 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  67.88 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  67.88 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  70 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 141 aa  190  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  68.12 
 
 		 140 aa  190  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  65.94 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  68.12 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 140 aa  186  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  65.47 
 
 		 141 aa  184  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 146 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 141 aa  180  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 141 aa  179  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002169  LSU ribosomal protein L11p (L12e)  64.29 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209a  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113672 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2870  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000138901  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  61.15 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00229  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  65.94 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1891  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  177  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  68.18 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 141 aa  178  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1623  50S ribosomal protein L11  70.29 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.838498  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3455  50S ribosomal protein L11P  62.14 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.270352 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0315  50S ribosomal protein L11  70.5 
 
 		 141 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000425279  hitchhiker  0.000807121 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2181  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 143 aa  177  5.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.296163  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 140 aa  177  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 141 aa  176  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  176  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 141 aa  176  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0486  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0527955  hitchhiker  0.00000142246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0315  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116049  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0826  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 143 aa  176  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08720  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 143 aa  176  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444282  hitchhiker  0.00204472 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0335  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00120454  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>