More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2187 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  100 
 
 		 162 aa  318  3e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  83.95 
 
 		 162 aa  274  4e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  84.62 
 
 		 157 aa  267  5e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  77.78 
 
 		 162 aa  252  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  78.85 
 
 		 158 aa  250  5.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  52.23 
 
 		 158 aa  177  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  53.5 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  50.64 
 
 		 161 aa  168  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  50.64 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  48.08 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  48.1 
 
 		 158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  49.36 
 
 		 161 aa  161  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  48.34 
 
 		 159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  48.34 
 
 		 159 aa  160  7e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  48.34 
 
 		 159 aa  160  7e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  49.67 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  47.02 
 
 		 159 aa  154  7e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  45.51 
 
 		 159 aa  147  9e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  47.37 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  43.05 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  37.66 
 
 		 170 aa  120  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  44.08 
 
 		 168 aa  117  9e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  37.11 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  41.48 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  39.71 
 
 		 143 aa  110  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  37.59 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  39.42 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  39.55 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  39.55 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  41.96 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  39.55 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  39.71 
 
 		 142 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  40.15 
 
 		 141 aa  107  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  40.3 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  38.69 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  38.97 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  40.46 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  40.88 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  37.88 
 
 		 140 aa  105  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  41.41 
 
 		 143 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  39.39 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  39.26 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  38.35 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  34.51 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  37.88 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0390  50S ribosomal protein L11  36.43 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  36.23 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  38.24 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  38.81 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  38.64 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  39.44 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  35.71 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  39.39 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  41.22 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  39.39 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  38.97 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  35.56 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  39.26 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  41.04 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  37.12 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  38.64 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  38.64 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  38.64 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  38.64 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  37.31 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  38.64 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  38.64 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  38.64 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  38.64 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  38.64 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  38.64 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  38.64 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  40 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  40.15 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  40 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  40 
 
 		 143 aa  100  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  36.03 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  35.21 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  35.56 
 
 		 140 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  37.88 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00045  50S ribosomal protein L11  37.78 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  39.85 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  40.44 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  37.88 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  35.71 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0260  50S ribosomal protein L11  34.31 
 
 		 141 aa  98.2  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2546  50S ribosomal protein L11  36.11 
 
 		 150 aa  98.6  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  34.07 
 
 		 141 aa  97.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  35.51 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  40.29 
 
 		 141 aa  97.8  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  35.82 
 
 		 146 aa  97.8  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  37.41 
 
 		 141 aa  97.8  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  41.22 
 
 		 142 aa  97.8  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  36.03 
 
 		 143 aa  97.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  36.84 
 
 		 141 aa  97.4  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  37.59 
 
 		 141 aa  97.4  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  37.59 
 
 		 141 aa  97.4  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>