More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3453 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  88.36 
 
 		 147 aa  270  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  82.88 
 
 		 147 aa  260  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1706  ribosomal protein L11  78.62 
 
 		 147 aa  241  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  75.17 
 
 		 147 aa  234  3e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00045  50S ribosomal protein L11  75.89 
 
 		 146 aa  230  4.0000000000000004e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0422  50S ribosomal protein L11  74.48 
 
 		 145 aa  230  6e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000957396  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0390  50S ribosomal protein L11  72.22 
 
 		 145 aa  229  9e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  73.1 
 
 		 145 aa  228  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1400  hypothetical protein  66.91 
 
 		 141 aa  203  7e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 146 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0486  50S ribosomal protein L11  64.08 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0527955  hitchhiker  0.00000142246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0315  50S ribosomal protein L11  64.08 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116049  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  57.14 
 
 		 141 aa  183  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  56.83 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  56.83 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  56.83 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 140 aa  180  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  56.12 
 
 		 141 aa  180  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 141 aa  180  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  55.63 
 
 		 163 aa  179  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  54.68 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  54.68 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  58.87 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0169  50S ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000273225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 140 aa  179  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 		 141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 		 141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 		 144 aa  177  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  55.4 
 
 		 141 aa  177  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5087  50S ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0150529  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 140 aa  177  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  52.86 
 
 		 141 aa  176  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1966  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2683  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000789076  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  59.12 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1943  50S ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0464106  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0192  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000446828  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  54.42 
 
 		 148 aa  174  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  52.14 
 
 		 164 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  57.04 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  55.4 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  173  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  56.12 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0315  50S ribosomal protein L11  60.99 
 
 		 141 aa  173  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000425279  hitchhiker  0.000807121 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  56.93 
 
 		 143 aa  173  6e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  56.12 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  52.52 
 
 		 141 aa  173  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1527  50S ribosomal protein L11  59.57 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0260  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 141 aa  173  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  57.04 
 
 		 143 aa  173  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3472  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 142 aa  173  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1346  50S ribosomal protein L11  58.87 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3692  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  56.12 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2277  50S ribosomal protein L11  57.75 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  55.4 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>