More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09660 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  100 
 
 		 163 aa  327  5.0000000000000004e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  77.99 
 
 		 162 aa  254  5e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2129  ribosomal protein L11  83.33 
 
 		 166 aa  249  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.248839  normal  0.745271 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  75.71 
 
 		 142 aa  216  8.999999999999998e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  67.63 
 
 		 143 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  67.15 
 
 		 141 aa  199  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 143 aa  198  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  68.12 
 
 		 141 aa  198  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  67.88 
 
 		 141 aa  197  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 141 aa  197  6e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 141 aa  197  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 141 aa  196  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  67.15 
 
 		 140 aa  196  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  67.15 
 
 		 140 aa  196  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 141 aa  196  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  70.29 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  66.91 
 
 		 143 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  67.15 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  67.88 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  65.94 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 143 aa  194  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 140 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  65.94 
 
 		 140 aa  194  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 		 141 aa  194  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 		 141 aa  194  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 		 141 aa  194  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 		 141 aa  194  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 		 141 aa  194  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 		 141 aa  194  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 		 141 aa  194  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 		 141 aa  194  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 		 141 aa  194  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 		 141 aa  194  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 		 141 aa  194  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 144 aa  194  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  65.94 
 
 		 143 aa  193  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  67.15 
 
 		 141 aa  193  8.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 142 aa  193  8.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 143 aa  193  9e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 143 aa  192  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 141 aa  191  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 144 aa  190  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 142 aa  190  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 141 aa  190  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  65.22 
 
 		 148 aa  189  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  63.31 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 147 aa  189  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 140 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  68.12 
 
 		 140 aa  188  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 140 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  68.12 
 
 		 140 aa  188  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  63.5 
 
 		 143 aa  187  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 142 aa  187  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 142 aa  187  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 140 aa  187  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 142 aa  186  9e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209a  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113672 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 145 aa  186  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 142 aa  185  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 141 aa  185  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 141 aa  185  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 141 aa  184  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  184  5e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 148 aa  183  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 143 aa  183  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 141 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  62.59 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 140 aa  183  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  62.86 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3937  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4329  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  65.12 
 
 		 144 aa  181  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 143 aa  181  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 141 aa  181  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>