More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0252 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  100 
 
 		 162 aa  315  1e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  82.69 
 
 		 157 aa  265  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  77.78 
 
 		 162 aa  252  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  77.16 
 
 		 162 aa  252  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  73.72 
 
 		 158 aa  231  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  53.5 
 
 		 158 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  51.92 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  52.23 
 
 		 158 aa  166  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  50.63 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  51.92 
 
 		 157 aa  163  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  48.72 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  46.41 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  48.37 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  48.08 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  46.15 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  45.1 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  45.1 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  50 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  44.67 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  43.71 
 
 		 159 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  40.91 
 
 		 170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  38.99 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  41.45 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  40.88 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  41.48 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  35.71 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  34.06 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  38.81 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  38.81 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  37.76 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_002950  PG0390  50S ribosomal protein L11  35.71 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  37.31 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  38.81 
 
 		 142 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  38.24 
 
 		 143 aa  101  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  34.29 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  39.29 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  39.26 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  38.81 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  37.88 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  37.12 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  38.17 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  37.23 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  37.96 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  37.96 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  39.69 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  38.81 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 141 aa  98.2  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  37.88 
 
 		 141 aa  98.2  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  39.84 
 
 		 143 aa  97.8  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  37.5 
 
 		 142 aa  97.8  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  34.81 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  36.76 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  36.3 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  37.31 
 
 		 141 aa  97.1  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  39.26 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  35.34 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  37.78 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  34.78 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  37.88 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  32.14 
 
 		 147 aa  96.3  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  36.5 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 141 aa  95.5  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 146 aa  95.5  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0422  50S ribosomal protein L11  33.09 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000957396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 141 aa  95.1  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  37.5 
 
 		 143 aa  94.4  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  34.31 
 
 		 148 aa  94.4  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  37.31 
 
 		 142 aa  94.4  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  36.57 
 
 		 143 aa  94  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  36.3 
 
 		 140 aa  94  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0312  ribosomal protein L11  33.82 
 
 		 143 aa  94  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000294677  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00045  50S ribosomal protein L11  34.07 
 
 		 146 aa  93.6  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  31.43 
 
 		 147 aa  93.6  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  39.26 
 
 		 143 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 140 aa  93.6  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0498  ribosomal protein L11  32.84 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  38.13 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  39.26 
 
 		 143 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  35.61 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  34.85 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  37.41 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  34.85 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  37.04 
 
 		 143 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  33.33 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  37.04 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  38.58 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1706  ribosomal protein L11  32.86 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0216759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>