More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2867 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
141 aa  285  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  93.57 
 
 
140 aa  266  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  87.86 
 
 
140 aa  258  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  87.86 
 
 
140 aa  258  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  87.86 
 
 
140 aa  257  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  88.57 
 
 
141 aa  256  9e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  86.43 
 
 
140 aa  249  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  76.43 
 
 
140 aa  224  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  72.99 
 
 
140 aa  210  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  68.79 
 
 
141 aa  209  9e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 
141 aa  207  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 
141 aa  207  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  70.8 
 
 
141 aa  206  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  70.07 
 
 
141 aa  206  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  70.5 
 
 
140 aa  206  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
143 aa  205  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 
141 aa  205  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
143 aa  205  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  70.21 
 
 
141 aa  204  3e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
143 aa  203  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
140 aa  203  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
142 aa  203  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  70 
 
 
143 aa  203  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  70 
 
 
143 aa  202  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  67.38 
 
 
141 aa  202  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  70.5 
 
 
140 aa  202  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  202  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 
141 aa  201  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  68.57 
 
 
143 aa  202  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5087  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 
142 aa  201  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0150529  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  69.57 
 
 
143 aa  201  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  67.88 
 
 
141 aa  201  3e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  66.67 
 
 
142 aa  201  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 
141 aa  201  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
141 aa  201  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 
141 aa  200  5e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2277  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 
142 aa  199  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362907  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  65 
 
 
143 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 
142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2806  50S ribosomal protein L11  68.12 
 
 
142 aa  197  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221343  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3201  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
142 aa  197  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3889  ribosomal protein L11  69.57 
 
 
142 aa  198  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0323173  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0506  50S ribosomal protein L11  70.29 
 
 
143 aa  197  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  66.43 
 
 
142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
143 aa  197  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3735  ribosomal protein L11  68.84 
 
 
142 aa  197  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257354  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0169  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
142 aa  197  5e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000273225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2363  50S ribosomal protein L11  65.31 
 
 
148 aa  197  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206524  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1588  50S ribosomal protein L11  65.31 
 
 
148 aa  197  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2275  50S ribosomal protein L11  65.31 
 
 
148 aa  197  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0335  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 
142 aa  196  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00120454  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1346  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
142 aa  196  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 
143 aa  196  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3864  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 
142 aa  196  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000881502  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3472  50S ribosomal protein L11  65 
 
 
142 aa  196  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275844  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03859  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000538182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4012  ribosomal protein L11  67.39 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000866586  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3455  50S ribosomal protein L11P  68.12 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.270352 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4391  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4042  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000015229  hitchhiker  0.00267408 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03812  hypothetical protein  67.39 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000676745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4431  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000394212  hitchhiker  0.00000226734 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4216  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.8656399999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3692  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4359  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00156245  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4478  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00436527  hitchhiker  0.00122683 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4555  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.011622  hitchhiker  0.000000000000800119 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  66.2 
 
 
143 aa  195  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4523  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000459439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4481  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0148745  decreased coverage  0.00000000000000460315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5448  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000790923  hitchhiker  0.00174431 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4471  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000366824  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3450  ribosomal protein L11  67.86 
 
 
153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0033133  normal  0.0131963 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 
140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0394  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 
143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904146  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 
142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2699  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 
142 aa  194  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  68.61 
 
 
140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>