More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3820 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
143 aa  286  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
143 aa  286  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
143 aa  286  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
143 aa  286  9e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
143 aa  286  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
143 aa  286  9e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
143 aa  286  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
143 aa  286  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  99.3 
 
 
143 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  98.6 
 
 
143 aa  282  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  98.6 
 
 
143 aa  282  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  97.9 
 
 
143 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  97.9 
 
 
143 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  97.9 
 
 
143 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  97.9 
 
 
143 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  95.1 
 
 
143 aa  278  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  94.41 
 
 
143 aa  276  6e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  94.41 
 
 
143 aa  275  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0042  50S ribosomal protein L11  90.21 
 
 
143 aa  269  8.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000150349  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3038  50S ribosomal protein L11  93.01 
 
 
143 aa  267  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0450649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  90.91 
 
 
143 aa  267  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3318  50S ribosomal protein L11  92.31 
 
 
143 aa  267  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586189  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2971  50S ribosomal protein L11  92.31 
 
 
143 aa  267  5e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.621539 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  89.44 
 
 
143 aa  265  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3193  50S ribosomal protein L11  93.01 
 
 
143 aa  265  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.177211  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0394  50S ribosomal protein L11  89.51 
 
 
143 aa  265  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904146  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3338  50S ribosomal protein L11  92.31 
 
 
143 aa  265  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  86.71 
 
 
143 aa  261  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3455  50S ribosomal protein L11P  89.51 
 
 
143 aa  261  3e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.270352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  86.71 
 
 
143 aa  259  6.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4446  50S ribosomal protein L11  87.41 
 
 
144 aa  259  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.258046  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0584  50S ribosomal protein L11  87.41 
 
 
143 aa  259  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3644  50S ribosomal protein L11  86.71 
 
 
144 aa  257  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416555 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3871  ribosomal protein L11  83.22 
 
 
143 aa  250  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0506  50S ribosomal protein L11  83.92 
 
 
143 aa  249  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0755  50S ribosomal protein L11  85.92 
 
 
143 aa  249  8.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3250  50S ribosomal protein L11  83.92 
 
 
143 aa  248  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3901  50S ribosomal protein L11  83.92 
 
 
143 aa  248  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3596  ribosomal protein L11  83.22 
 
 
143 aa  247  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2260  50S ribosomal protein L11  81.82 
 
 
143 aa  244  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44071  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4535  50S ribosomal protein L11  81.82 
 
 
143 aa  245  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438276  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  79.02 
 
 
143 aa  241  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  79.02 
 
 
143 aa  239  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  79.02 
 
 
143 aa  235  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  74.13 
 
 
143 aa  233  9e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  76.22 
 
 
143 aa  232  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0745  50S ribosomal protein L11  76.76 
 
 
142 aa  232  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00286512  normal  0.949117 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0920  50S ribosomal protein L11  74.83 
 
 
143 aa  227  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000795353  hitchhiker  0.00000174139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3920  50S ribosomal protein L11  75.52 
 
 
143 aa  225  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848211  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06120  50S ribosomal protein L11  74.13 
 
 
143 aa  224  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  74.83 
 
 
143 aa  223  5.0000000000000005e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0826  50S ribosomal protein L11  74.13 
 
 
143 aa  223  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08720  50S ribosomal protein L11  74.13 
 
 
143 aa  223  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444282  hitchhiker  0.00204472 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  74.13 
 
 
143 aa  221  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2040  50S ribosomal protein L11  74.83 
 
 
143 aa  221  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000854354  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  74.65 
 
 
142 aa  221  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  74.13 
 
 
148 aa  220  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04534  50S ribosomal protein L11  73.94 
 
 
142 aa  220  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1891  50S ribosomal protein L11  73.43 
 
 
143 aa  219  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5090  50S ribosomal protein L11  72.73 
 
 
143 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000105007  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2181  50S ribosomal protein L11  73.43 
 
 
143 aa  218  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.296163  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0443  50S ribosomal protein L11  72.73 
 
 
143 aa  217  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273232  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0473  50S ribosomal protein L11  72.73 
 
 
143 aa  217  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.015667  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0476  50S ribosomal protein L11  72.73 
 
 
143 aa  217  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000067383  normal  0.0123717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4760  50S ribosomal protein L11  72.73 
 
 
143 aa  217  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000974914  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0315  50S ribosomal protein L11  71.83 
 
 
142 aa  216  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0486  50S ribosomal protein L11  71.83 
 
 
142 aa  216  7e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0527955  hitchhiker  0.00000142246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0615  ribosomal protein L11  71.33 
 
 
143 aa  215  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.956774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4559  50S ribosomal protein L11  71.33 
 
 
143 aa  215  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275981  normal  0.0500923 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2200  50S ribosomal protein L11  70.42 
 
 
169 aa  216  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723697  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  73.43 
 
 
143 aa  216  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2111  50S ribosomal protein L11  69.72 
 
 
169 aa  213  5e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000939777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  72.34 
 
 
140 aa  210  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  71.83 
 
 
142 aa  209  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4287  50S ribosomal protein L11  68.53 
 
 
144 aa  208  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000848232  hitchhiker  0.000000453889 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4773  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
142 aa  206  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0832253  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1866  50S ribosomal protein L11  68.06 
 
 
145 aa  205  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000205229  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0323  50S ribosomal protein L11  68.75 
 
 
145 aa  206  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00428348  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03859  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
142 aa  205  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000538182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4012  ribosomal protein L11  68.09 
 
 
142 aa  205  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000866586  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4391  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
142 aa  205  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3735  ribosomal protein L11  67.38 
 
 
142 aa  205  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
140 aa  205  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4555  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
142 aa  205  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.011622  hitchhiker  0.000000000000800119 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4481  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
142 aa  205  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0148745  decreased coverage  0.00000000000000460315 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4042  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
142 aa  205  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000015229  hitchhiker  0.00267408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4216  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
142 aa  205  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.8656399999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03812  hypothetical protein  68.09 
 
 
142 aa  205  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000676745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5448  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
142 aa  205  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000790923  hitchhiker  0.00174431 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3889  ribosomal protein L11  67.38 
 
 
142 aa  204  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0323173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4431  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
142 aa  205  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000394212  hitchhiker  0.00000226734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4478  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
142 aa  205  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00436527  hitchhiker  0.00122683 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4523  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
142 aa  205  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000459439  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4471  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
142 aa  205  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000366824  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0312  ribosomal protein L11  67.13 
 
 
143 aa  204  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000294677  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4359  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
142 aa  205  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00156245  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 
142 aa  204  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 
142 aa  204  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2726  50S ribosomal protein L11  66.9 
 
 
142 aa  203  7e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093206  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002169  LSU ribosomal protein L11p (L12e)  67.61 
 
 
142 aa  203  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>