More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1545 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  100 
 
 
140 aa  284  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  78.42 
 
 
140 aa  227  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  77.14 
 
 
140 aa  225  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  78.42 
 
 
141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  74.29 
 
 
140 aa  222  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  75.71 
 
 
140 aa  220  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  75.54 
 
 
140 aa  218  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  75 
 
 
140 aa  216  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  72.86 
 
 
141 aa  215  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  74.29 
 
 
140 aa  214  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  76.6 
 
 
143 aa  214  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  76.6 
 
 
143 aa  213  9e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 
143 aa  212  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  75.89 
 
 
143 aa  212  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  72.66 
 
 
141 aa  212  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 
140 aa  210  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  74.1 
 
 
140 aa  210  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 
143 aa  210  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 
143 aa  210  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 
143 aa  210  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 
143 aa  210  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 
143 aa  210  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 
143 aa  210  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 
143 aa  210  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 
143 aa  210  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 
143 aa  208  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  75.89 
 
 
143 aa  208  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  71.22 
 
 
140 aa  208  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 
142 aa  207  6e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  70.5 
 
 
141 aa  206  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0826  50S ribosomal protein L11  73.76 
 
 
143 aa  206  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222387  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
143 aa  206  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08720  50S ribosomal protein L11  73.76 
 
 
143 aa  206  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444282  hitchhiker  0.00204472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
143 aa  206  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
143 aa  206  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
143 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
143 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
143 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  74.47 
 
 
143 aa  206  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 
143 aa  206  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0443  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 
143 aa  204  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273232  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4760  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 
143 aa  204  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000974914  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  73.76 
 
 
142 aa  205  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
143 aa  204  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 
141 aa  205  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  71.94 
 
 
141 aa  205  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0476  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 
143 aa  204  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000067383  normal  0.0123717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0473  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 
143 aa  204  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.015667  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3871  ribosomal protein L11  73.05 
 
 
143 aa  204  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 
140 aa  204  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  71.63 
 
 
143 aa  204  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  72.34 
 
 
143 aa  204  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0394  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 
143 aa  203  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904146  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  72.34 
 
 
143 aa  203  6e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  70.5 
 
 
141 aa  203  6e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  70.71 
 
 
140 aa  203  6e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  71.43 
 
 
141 aa  203  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0042  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
143 aa  202  9e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000150349  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
143 aa  202  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 
141 aa  202  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  70.71 
 
 
141 aa  202  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  71.63 
 
 
143 aa  201  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06120  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 
143 aa  201  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3920  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 
143 aa  201  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848211  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 
141 aa  201  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3644  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
144 aa  201  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416555 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 
141 aa  200  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5090  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
143 aa  200  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000105007  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  72.86 
 
 
140 aa  200  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  72.86 
 
 
140 aa  200  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4446  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
144 aa  200  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.258046  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  73.05 
 
 
148 aa  199  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 
140 aa  199  9e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 
143 aa  199  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 
143 aa  199  9e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3455  50S ribosomal protein L11P  68.09 
 
 
143 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.270352 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0755  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 
143 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3318  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 
143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586189  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3038  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 
143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0450649 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
141 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
141 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
141 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
141 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
141 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
141 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
141 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
141 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
141 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3338  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 
143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
141 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
141 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2971  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 
143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.621539 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 
141 aa  197  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3193  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 
143 aa  197  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.177211  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0920  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
143 aa  198  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000795353  hitchhiker  0.00000174139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3596  ribosomal protein L11  67.38 
 
 
143 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 
142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0584  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
143 aa  197  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0506  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 
143 aa  197  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  68.57 
 
 
141 aa  197  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>