More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4680 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 143 aa  284  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  70.42 
 
 		 140 aa  202  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  69.01 
 
 		 141 aa  200  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  71.13 
 
 		 140 aa  199  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  68.31 
 
 		 141 aa  198  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  70.42 
 
 		 142 aa  197  5e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  67.61 
 
 		 140 aa  197  6e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  68.31 
 
 		 140 aa  196  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  68.31 
 
 		 140 aa  196  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  68.31 
 
 		 143 aa  196  7.999999999999999e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 141 aa  195  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  69.01 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  69.01 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  68.31 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 140 aa  191  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 140 aa  192  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3735  ribosomal protein L11  70.5 
 
 		 142 aa  191  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3889  ribosomal protein L11  70.5 
 
 		 142 aa  190  6e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0323173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  69.72 
 
 		 141 aa  190  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 140 aa  189  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  64.08 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2806  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221343  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 143 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 141 aa  187  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 141 aa  187  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 141 aa  187  4e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0335  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00120454  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3864  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000881502  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0273  ribosomal protein L11  69.06 
 
 		 142 aa  187  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225698  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 148 aa  187  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 141 aa  186  9e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2275  50S ribosomal protein L11  65.07 
 
 		 148 aa  186  9e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1588  50S ribosomal protein L11  65.07 
 
 		 148 aa  186  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 		 144 aa  186  9e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2363  50S ribosomal protein L11  65.07 
 
 		 148 aa  186  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 143 aa  186  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2225  50S ribosomal protein L11  65.07 
 
 		 148 aa  186  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901746 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 140 aa  186  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  67.61 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0177  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0566488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  66.9 
 
 		 142 aa  183  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 140 aa  183  7e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 141 aa  183  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03859  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000538182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4012  ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000866586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4216  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.8656399999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 140 aa  183  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 140 aa  183  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4391  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4471  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000366824  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4481  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0148745  decreased coverage  0.00000000000000460315 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4431  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000394212  hitchhiker  0.00000226734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4478  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00436527  hitchhiker  0.00122683 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4042  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000015229  hitchhiker  0.00267408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4359  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00156245  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4555  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.011622  hitchhiker  0.000000000000800119 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5448  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000790923  hitchhiker  0.00174431 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03812  hypothetical protein  66.91 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000676745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4523  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 142 aa  183  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000459439  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4773  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 142 aa  183  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0832253  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1667  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 140 aa  182  9e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00198224  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0170  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0415128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2040  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000854354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0445  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00177755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0524  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0672587  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1460  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000504734  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0505  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399461  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00229  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 146 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>