More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0094 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
141 aa  279  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  98.58 
 
 
141 aa  277  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  95.04 
 
 
141 aa  271  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  95.04 
 
 
141 aa  271  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  95.04 
 
 
141 aa  271  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  95.04 
 
 
141 aa  271  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  95.04 
 
 
141 aa  271  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  95.04 
 
 
141 aa  271  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  95.04 
 
 
141 aa  271  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  95.04 
 
 
141 aa  271  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  95.04 
 
 
141 aa  271  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  95.04 
 
 
141 aa  271  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  95.04 
 
 
141 aa  271  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  85.71 
 
 
140 aa  241  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  85.71 
 
 
140 aa  241  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  82.86 
 
 
140 aa  238  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  82.14 
 
 
141 aa  234  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  77.86 
 
 
141 aa  234  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  80.14 
 
 
141 aa  232  1.0000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  80.58 
 
 
142 aa  229  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  76.6 
 
 
141 aa  229  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  79.43 
 
 
141 aa  229  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  78.72 
 
 
141 aa  227  4e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  79.86 
 
 
142 aa  226  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  77.46 
 
 
142 aa  226  7e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  77.86 
 
 
140 aa  226  8e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  75 
 
 
141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  75.18 
 
 
141 aa  222  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  75.54 
 
 
141 aa  222  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  75.54 
 
 
141 aa  222  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  74.47 
 
 
141 aa  222  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  76.98 
 
 
142 aa  220  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  71.63 
 
 
141 aa  221  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
141 aa  219  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
141 aa  219  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  72.34 
 
 
164 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  76.98 
 
 
142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  76.98 
 
 
141 aa  217  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 
141 aa  216  7.999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
141 aa  216  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  70.92 
 
 
141 aa  215  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0308  50S ribosomal protein L11  78.72 
 
 
141 aa  212  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000373457  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  76.98 
 
 
140 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 
141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 
141 aa  211  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 
141 aa  210  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 
141 aa  209  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 
141 aa  209  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
141 aa  209  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
141 aa  209  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2724  ribosomal protein L11  79.55 
 
 
143 aa  208  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.239254  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  70.71 
 
 
140 aa  207  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 
141 aa  207  3e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  72.99 
 
 
141 aa  207  6e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  70.21 
 
 
141 aa  207  6e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  70 
 
 
140 aa  205  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  70.71 
 
 
140 aa  205  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  70.5 
 
 
140 aa  204  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  204  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  73.38 
 
 
140 aa  204  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  69.29 
 
 
140 aa  204  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
141 aa  204  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  70.21 
 
 
141 aa  203  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02801  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 
141 aa  203  7e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.219734  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 
141 aa  203  7e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 
141 aa  203  7e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0356  50S ribosomal protein L11  76.6 
 
 
143 aa  202  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000696128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  69.78 
 
 
144 aa  202  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  70.71 
 
 
140 aa  202  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
140 aa  201  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
140 aa  201  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
141 aa  201  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 
141 aa  201  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  66.19 
 
 
143 aa  199  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  64.54 
 
 
141 aa  199  9e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 
140 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 
141 aa  198  3e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
140 aa  197  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 
140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 
141 aa  197  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  68.35 
 
 
141 aa  196  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  68.79 
 
 
143 aa  196  7e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  70.8 
 
 
140 aa  196  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  69.57 
 
 
163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  66.43 
 
 
145 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 
140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  66.67 
 
 
142 aa  194  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  68.84 
 
 
143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00045  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 
146 aa  193  5.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  66.67 
 
 
143 aa  193  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0273  ribosomal protein L11  67.61 
 
 
142 aa  193  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225698  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 
145 aa  193  8.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4555  50S ribosomal protein L11  68.31 
 
 
142 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.011622  hitchhiker  0.000000000000800119 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2683  50S ribosomal protein L11  74.29 
 
 
141 aa  192  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000789076  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4471  50S ribosomal protein L11  68.31 
 
 
142 aa  192  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
141 aa  192  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4431  50S ribosomal protein L11  68.31 
 
 
142 aa  192  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000394212  hitchhiker  0.00000226734 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5448  50S ribosomal protein L11  68.31 
 
 
142 aa  192  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000790923  hitchhiker  0.00174431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>