More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0412 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  100 
 
 		 158 aa  309  9e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  79.75 
 
 		 158 aa  257  4e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  76.43 
 
 		 158 aa  244  4e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  78.43 
 
 		 157 aa  240  3.9999999999999997e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  73.89 
 
 		 158 aa  234  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  58.23 
 
 		 161 aa  188  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  61.84 
 
 		 160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  58.97 
 
 		 161 aa  187  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  60.13 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  60.13 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  58.86 
 
 		 159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  59.49 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  53.5 
 
 		 162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  59.21 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  54.49 
 
 		 157 aa  167  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  52.23 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  52.23 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  52.56 
 
 		 158 aa  163  8e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  51.27 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  51.32 
 
 		 159 aa  160  8.000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  45.16 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  52.63 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  40.79 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  38.97 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  39.44 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  41.22 
 
 		 141 aa  97.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3288  ribosomal protein L11  35.11 
 
 		 141 aa  97.4  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0476152  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  38.93 
 
 		 141 aa  97.1  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  37.59 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  36.43 
 
 		 145 aa  96.3  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  35.61 
 
 		 141 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 		 144 aa  95.5  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  35.61 
 
 		 141 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  38.93 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  37.78 
 
 		 141 aa  94.4  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  37.4 
 
 		 140 aa  94  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  37.96 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  38.35 
 
 		 144 aa  93.6  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 140 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1806  50S ribosomal protein L11  36.76 
 
 		 142 aa  93.6  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.785581  normal  0.199785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  34.85 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  35.61 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0439  ribosomal protein L11  37.4 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  34.07 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30315  Putative mitochondrial ribosomal protein L11  38.06 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  37.59 
 
 		 144 aa  91.3  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  37.12 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3338  50S ribosomal protein L11  38.81 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  35.61 
 
 		 140 aa  90.9  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0676  ribosomal protein L11  32.1 
 
 		 169 aa  90.9  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  38.17 
 
 		 141 aa  90.5  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  38.85 
 
 		 141 aa  90.5  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3193  50S ribosomal protein L11  38.06 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.177211  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  34.85 
 
 		 141 aa  90.5  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  34.35 
 
 		 142 aa  90.5  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  35.61 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3318  50S ribosomal protein L11  38.06 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2971  50S ribosomal protein L11  38.06 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.621539 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  34.56 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  36.96 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  34.85 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  35.11 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3038  50S ribosomal protein L11  37.31 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0450649 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  38.06 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1832  50S ribosomal protein L11P  35.48 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  35.07 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  36.36 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  34.31 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  36.64 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  38.13 
 
 		 141 aa  89.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  36.5 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  35.82 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1400  hypothetical protein  35.61 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  37.12 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  35.88 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  38.81 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  33.82 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  36.3 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  34.31 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  33.58 
 
 		 141 aa  87.8  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  35.88 
 
 		 141 aa  87.4  7e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>