More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3288 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3288  ribosomal protein L11  100 
 
 		 141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0476152  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  57.45 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  54.61 
 
 		 141 aa  168  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  56.43 
 
 		 140 aa  167  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  54.61 
 
 		 141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 		 141 aa  160  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  52.52 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 		 142 aa  156  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  53.24 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  51.06 
 
 		 141 aa  154  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  49.65 
 
 		 141 aa  154  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  52.48 
 
 		 141 aa  153  7e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  52.52 
 
 		 141 aa  153  9e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  52.52 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  51.43 
 
 		 140 aa  153  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  48.23 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  49.65 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  51.43 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  49.65 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  52.48 
 
 		 141 aa  150  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  51.8 
 
 		 141 aa  150  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  48.94 
 
 		 141 aa  150  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  48.92 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  48.92 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 		 141 aa  149  8.999999999999999e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  51.06 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  49.65 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  48.94 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  51.8 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  51.06 
 
 		 141 aa  148  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  51.8 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  51.06 
 
 		 141 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  48.23 
 
 		 141 aa  147  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  51.82 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  54.01 
 
 		 143 aa  147  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  50.36 
 
 		 140 aa  147  6e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  52.14 
 
 		 140 aa  147  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  50.36 
 
 		 140 aa  147  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  51.43 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0445  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00177755  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  48.94 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0524  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0672587  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0505  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399461  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  49.64 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1460  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000504734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  48.94 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  49.65 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  49.65 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4329  50S ribosomal protein L11  50.36 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3937  50S ribosomal protein L11  50.36 
 
 		 143 aa  144  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  51.82 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  49.64 
 
 		 140 aa  145  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  51.09 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  51.82 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  53.57 
 
 		 143 aa  144  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  50.71 
 
 		 141 aa  143  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1320  50S ribosomal protein L11  50.35 
 
 		 141 aa  143  9e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800207  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  51.08 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  46.76 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  46.1 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  51.08 
 
 		 140 aa  143  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  51.09 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  49.64 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  48.92 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1806  50S ribosomal protein L11  47.89 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.785581  normal  0.199785 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0170  50S ribosomal protein L11  48.23 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0415128  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  46.04 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0349  ribosomal protein L11  48.94 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0127148  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  45.39 
 
 		 141 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  45.39 
 
 		 141 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1891  50S ribosomal protein L11  50 
 
 		 143 aa  140  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  44.68 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0177  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 		 141 aa  140  7e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0566488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  49.64 
 
 		 142 aa  139  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  47.52 
 
 		 141 aa  139  9e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  48.2 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0349  ribosomal protein L11  46.1 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00040646  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  51.09 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>