More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0349 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0349  ribosomal protein L11  100 
 
 
141 aa  279  7.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0127148  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1320  50S ribosomal protein L11  85.11 
 
 
141 aa  247  4e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800207  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0170  50S ribosomal protein L11  85.11 
 
 
141 aa  247  5e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0415128  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0177  50S ribosomal protein L11  84.4 
 
 
141 aa  246  9e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0566488  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0505  50S ribosomal protein L11  81.56 
 
 
141 aa  241  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399461  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0524  50S ribosomal protein L11  81.56 
 
 
141 aa  241  3e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0672587  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1460  50S ribosomal protein L11  81.56 
 
 
141 aa  241  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000504734  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0445  50S ribosomal protein L11  81.56 
 
 
141 aa  240  3.9999999999999997e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00177755  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1667  50S ribosomal protein L11  81.29 
 
 
140 aa  236  1e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00198224  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0349  ribosomal protein L11  75.18 
 
 
141 aa  220  7e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00040646  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  65.25 
 
 
141 aa  187  5e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  66.19 
 
 
140 aa  183  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 
142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  63.31 
 
 
141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  63.31 
 
 
143 aa  181  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 
141 aa  179  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  65 
 
 
143 aa  179  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 
143 aa  179  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  63.77 
 
 
143 aa  179  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  63.31 
 
 
143 aa  179  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  62.14 
 
 
143 aa  177  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  60.99 
 
 
141 aa  177  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 
141 aa  177  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 
140 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 
141 aa  176  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1045  ribosomal protein L11  63.31 
 
 
142 aa  176  8e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104784  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3735  ribosomal protein L11  61.27 
 
 
142 aa  176  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257354  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 
140 aa  176  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2563  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 
143 aa  176  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 
141 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0833  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 
143 aa  176  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.714386  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3318  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 
143 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586189  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
143 aa  176  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 
141 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  59.57 
 
 
141 aa  176  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2971  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 
143 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.621539 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3038  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
143 aa  175  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0450649 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
143 aa  175  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 
140 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 
141 aa  175  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 
143 aa  175  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  62.14 
 
 
141 aa  175  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0506  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 
143 aa  175  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3889  ribosomal protein L11  61.27 
 
 
142 aa  175  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0323173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  62.86 
 
 
143 aa  175  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 
140 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
143 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
143 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
143 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
143 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
143 aa  174  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
143 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 
140 aa  174  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
140 aa  174  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
143 aa  174  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 
141 aa  174  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
143 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
143 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  65 
 
 
143 aa  174  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
143 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
143 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
143 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
140 aa  174  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  58.99 
 
 
143 aa  174  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 
141 aa  174  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 
143 aa  174  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 
141 aa  174  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 
141 aa  174  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 
141 aa  174  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 
141 aa  174  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 
141 aa  174  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 
141 aa  174  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 
141 aa  174  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 
141 aa  174  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 
141 aa  174  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  59.57 
 
 
141 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 
141 aa  174  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  58.87 
 
 
142 aa  174  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3338  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 
143 aa  174  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 
142 aa  174  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 
143 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 
141 aa  174  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 
143 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 
143 aa  174  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 
142 aa  174  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0042  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 
143 aa  174  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000150349  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  63.31 
 
 
143 aa  174  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 
143 aa  174  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1442  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 
143 aa  174  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.337085  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  60.43 
 
 
146 aa  174  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  62.14 
 
 
143 aa  174  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  60.99 
 
 
141 aa  174  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3193  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
143 aa  173  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.177211  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 
141 aa  173  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 
142 aa  173  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2699  50S ribosomal protein L11  58.45 
 
 
142 aa  173  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 
143 aa  173  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
143 aa  173  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 
142 aa  173  8e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 
140 aa  173  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>