More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2706 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
143 aa  286  8e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
143 aa  286  8e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  90.21 
 
 
143 aa  264  4e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  88.11 
 
 
143 aa  254  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  88.65 
 
 
143 aa  254  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  86.01 
 
 
143 aa  253  7e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  83.8 
 
 
143 aa  248  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  83.8 
 
 
143 aa  243  8e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  82.39 
 
 
142 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  82.39 
 
 
142 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  82.39 
 
 
142 aa  237  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  82.39 
 
 
142 aa  237  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  82.39 
 
 
142 aa  236  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  82.27 
 
 
143 aa  235  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  82.39 
 
 
142 aa  234  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  81.29 
 
 
143 aa  228  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  77.3 
 
 
143 aa  229  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  76.76 
 
 
142 aa  228  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  78.32 
 
 
143 aa  228  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  81.16 
 
 
144 aa  228  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  76.92 
 
 
143 aa  223  6e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  75.89 
 
 
144 aa  222  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  77.14 
 
 
144 aa  221  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  77.14 
 
 
144 aa  221  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  73.24 
 
 
142 aa  219  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  71.83 
 
 
143 aa  215  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  71.13 
 
 
142 aa  214  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  80.62 
 
 
144 aa  213  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
143 aa  213  9e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
143 aa  210  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  71.74 
 
 
144 aa  208  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  75.97 
 
 
143 aa  204  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3937  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
143 aa  202  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4329  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
143 aa  202  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  71.53 
 
 
140 aa  202  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  66.9 
 
 
142 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  67.15 
 
 
142 aa  199  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  70.07 
 
 
141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
148 aa  196  6e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  70.07 
 
 
140 aa  196  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  70.07 
 
 
140 aa  196  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  67.39 
 
 
140 aa  195  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  66.19 
 
 
163 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
140 aa  194  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  68.61 
 
 
140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  68.61 
 
 
140 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
140 aa  193  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 
142 aa  193  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  70.29 
 
 
140 aa  193  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 
140 aa  192  9e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209a  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
143 aa  192  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113672 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  67.88 
 
 
141 aa  192  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  67.88 
 
 
140 aa  192  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  65.71 
 
 
142 aa  192  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1623  50S ribosomal protein L11  73.76 
 
 
143 aa  192  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.838498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  67.39 
 
 
140 aa  191  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  65.94 
 
 
141 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  65.94 
 
 
141 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  68.12 
 
 
140 aa  191  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  68.12 
 
 
140 aa  191  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  64.08 
 
 
142 aa  191  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 
144 aa  191  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  67.15 
 
 
141 aa  190  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 
141 aa  190  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 
141 aa  189  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 
140 aa  189  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  66.19 
 
 
141 aa  188  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 
143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  64.49 
 
 
141 aa  187  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  65.71 
 
 
142 aa  187  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 
164 aa  187  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  65.22 
 
 
141 aa  186  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  66.43 
 
 
143 aa  186  9e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  65.94 
 
 
140 aa  186  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  67.14 
 
 
143 aa  186  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 
141 aa  186  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 
141 aa  186  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4446  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 
144 aa  186  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.258046  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  62.32 
 
 
141 aa  186  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  66.19 
 
 
146 aa  185  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
143 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
143 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1891  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 
143 aa  185  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
143 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
143 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
143 aa  185  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
143 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2181  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
143 aa  185  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.296163  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
143 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
143 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
143 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  67.15 
 
 
141 aa  185  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  64.49 
 
 
141 aa  184  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  65.94 
 
 
141 aa  184  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 
141 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 
141 aa  184  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 
141 aa  184  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 
140 aa  184  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 
141 aa  184  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  65 
 
 
143 aa  184  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>