More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2785 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  100 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  75.71 
 
 		 140 aa  224  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  75 
 
 		 141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  74.29 
 
 		 140 aa  216  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  74.29 
 
 		 140 aa  214  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  75 
 
 		 140 aa  212  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  73.38 
 
 		 140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 140 aa  208  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 141 aa  207  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  72.14 
 
 		 141 aa  206  8e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  73.76 
 
 		 143 aa  205  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  71.63 
 
 		 143 aa  202  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 		 140 aa  199  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  71.22 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  71.22 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  71.63 
 
 		 142 aa  197  5e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 		 143 aa  196  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 143 aa  195  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 		 143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 141 aa  194  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 141 aa  194  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 140 aa  194  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 142 aa  194  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 143 aa  193  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 141 aa  193  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 142 aa  193  8.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  68.57 
 
 		 141 aa  192  9e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4773  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0832253  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 141 aa  192  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  67.15 
 
 		 144 aa  192  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  66.43 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 143 aa  191  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  63.31 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  65.94 
 
 		 144 aa  191  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  65.94 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 141 aa  190  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 142 aa  190  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  65 
 
 		 141 aa  190  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 141 aa  189  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 		 142 aa  190  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  68.12 
 
 		 144 aa  190  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 140 aa  189  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 142 aa  189  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 140 aa  189  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 141 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 141 aa  188  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 		 142 aa  188  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03859  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000538182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4012  ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000866586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4471  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000366824  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4523  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000459439  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4216  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.8656399999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4391  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058803  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4555  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.011622  hitchhiker  0.000000000000800119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4431  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000394212  hitchhiker  0.00000226734 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03812  hypothetical protein  65.96 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000676745  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4481  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0148745  decreased coverage  0.00000000000000460315 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 141 aa  187  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4359  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00156245  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5448  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000790923  hitchhiker  0.00174431 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4478  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00436527  hitchhiker  0.00122683 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  65.22 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4042  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000015229  hitchhiker  0.00267408 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  65.94 
 
 		 143 aa  187  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 143 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3864  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 142 aa  187  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000881502  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 143 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 143 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 143 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 143 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 143 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 143 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>