More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2992 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
140 aa  281  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  84.29 
 
 
140 aa  243  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  80 
 
 
140 aa  236  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  81.43 
 
 
140 aa  233  7e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  77.14 
 
 
140 aa  225  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  76.43 
 
 
141 aa  223  9e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  71.94 
 
 
141 aa  215  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  75 
 
 
140 aa  212  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  73.38 
 
 
140 aa  210  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  73.76 
 
 
143 aa  209  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  73.76 
 
 
143 aa  207  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  72.86 
 
 
140 aa  205  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  72.34 
 
 
143 aa  202  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
140 aa  200  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 
143 aa  197  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
143 aa  198  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  70.21 
 
 
143 aa  197  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
141 aa  196  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
141 aa  196  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 
143 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  70.92 
 
 
142 aa  196  7.999999999999999e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 
143 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 
143 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 
143 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  69.5 
 
 
143 aa  196  9e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 
141 aa  195  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  71.43 
 
 
141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
143 aa  195  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 
143 aa  194  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 
140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 
140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  64.75 
 
 
141 aa  193  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 
148 aa  193  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
141 aa  193  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 
143 aa  193  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 
140 aa  193  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  64.75 
 
 
141 aa  193  8.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 
143 aa  192  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0042  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 
143 aa  192  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000150349  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  69.5 
 
 
143 aa  192  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0473  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
143 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.015667  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0443  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
143 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273232  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4773  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 
142 aa  192  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0832253  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  69.06 
 
 
143 aa  191  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0476  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
143 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000067383  normal  0.0123717 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 
141 aa  191  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4760  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
143 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000974914  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 
140 aa  191  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 
141 aa  191  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 
143 aa  191  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 
140 aa  191  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 
143 aa  191  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 
141 aa  191  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 
140 aa  191  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 
140 aa  191  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0826  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 
143 aa  191  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08720  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 
143 aa  191  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444282  hitchhiker  0.00204472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  68.84 
 
 
142 aa  191  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 
141 aa  191  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 
142 aa  190  5e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 
143 aa  190  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 
147 aa  190  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 
141 aa  190  6e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 
141 aa  190  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 
142 aa  190  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06120  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 
143 aa  189  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0394  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 
143 aa  190  7e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904146  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 
142 aa  189  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 
142 aa  189  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 
141 aa  189  8e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  65.47 
 
 
141 aa  189  8e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 
164 aa  189  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  68.61 
 
 
143 aa  189  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3920  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 
143 aa  189  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848211  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 
142 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 
142 aa  189  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 
141 aa  188  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
141 aa  188  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5090  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
143 aa  188  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000105007  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  65 
 
 
141 aa  188  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 
141 aa  188  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0745  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
142 aa  188  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00286512  normal  0.949117 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0755  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 
143 aa  188  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 
143 aa  189  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02801  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
141 aa  188  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.219734  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 
143 aa  189  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  67.38 
 
 
143 aa  188  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 
141 aa  187  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>