More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0696 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  100 
 
 		 142 aa  288  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  81.43 
 
 		 143 aa  241  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  78.72 
 
 		 143 aa  237  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  79.14 
 
 		 142 aa  235  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  80 
 
 		 143 aa  234  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  79.29 
 
 		 143 aa  233  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  76.43 
 
 		 143 aa  231  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  80 
 
 		 143 aa  231  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  77.46 
 
 		 143 aa  230  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  78.42 
 
 		 143 aa  229  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  76.43 
 
 		 143 aa  227  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  73.94 
 
 		 143 aa  226  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  76.26 
 
 		 143 aa  224  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  74.82 
 
 		 144 aa  224  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  75.54 
 
 		 142 aa  223  8e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  72.86 
 
 		 142 aa  223  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  74.65 
 
 		 142 aa  221  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  74.65 
 
 		 142 aa  221  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  77.3 
 
 		 144 aa  221  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  74.65 
 
 		 142 aa  221  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  74.65 
 
 		 142 aa  220  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  76.98 
 
 		 142 aa  219  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  73.24 
 
 		 143 aa  219  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  73.24 
 
 		 143 aa  219  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  73.94 
 
 		 142 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  74.13 
 
 		 143 aa  217  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  72.54 
 
 		 142 aa  215  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  72.73 
 
 		 144 aa  211  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  70.63 
 
 		 144 aa  210  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  67.61 
 
 		 143 aa  208  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  69.01 
 
 		 143 aa  208  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4329  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 143 aa  205  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3937  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 143 aa  205  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  75.78 
 
 		 144 aa  205  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  69.85 
 
 		 141 aa  201  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  69.85 
 
 		 141 aa  201  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  70.37 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  69.5 
 
 		 144 aa  200  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  69.12 
 
 		 141 aa  200  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  72.09 
 
 		 143 aa  197  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  67.15 
 
 		 141 aa  197  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  69.12 
 
 		 141 aa  196  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  70.37 
 
 		 140 aa  196  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  70.37 
 
 		 140 aa  196  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  68.89 
 
 		 140 aa  196  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  69.12 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  65.94 
 
 		 163 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  65.44 
 
 		 141 aa  193  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 142 aa  192  9e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  69.12 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  64.44 
 
 		 140 aa  192  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  66.18 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  65.94 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  65.22 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  68.89 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  65.93 
 
 		 140 aa  191  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  66.18 
 
 		 141 aa  190  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  66.18 
 
 		 141 aa  190  5e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  65.44 
 
 		 164 aa  190  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  69.57 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  65.93 
 
 		 141 aa  189  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209a  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 143 aa  189  8e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113672 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  65.44 
 
 		 141 aa  189  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  65.93 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  65.19 
 
 		 141 aa  189  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  65.44 
 
 		 141 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  65.94 
 
 		 140 aa  188  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  65.93 
 
 		 140 aa  188  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1174  ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000246208  unclonable  0.0000000192361 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  65.94 
 
 		 140 aa  188  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1623  50S ribosomal protein L11  70 
 
 		 143 aa  187  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.838498  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 140 aa  187  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  67.41 
 
 		 141 aa  186  7e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  64.44 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  65.19 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  65.19 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  186  9e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  63.7 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  64.44 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  62.96 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 140 aa  186  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>