More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0742 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  100 
 
 
143 aa  291  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  95.8 
 
 
142 aa  275  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  96.4 
 
 
142 aa  274  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  96.4 
 
 
142 aa  274  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  94.41 
 
 
142 aa  271  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  95.68 
 
 
142 aa  271  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  90.91 
 
 
144 aa  265  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  94.24 
 
 
142 aa  265  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  87.41 
 
 
144 aa  259  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  88.81 
 
 
143 aa  248  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  83.1 
 
 
144 aa  247  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  84.62 
 
 
143 aa  242  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  81.82 
 
 
142 aa  240  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  83.1 
 
 
143 aa  235  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  80.99 
 
 
143 aa  233  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  77.62 
 
 
143 aa  231  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  78.87 
 
 
144 aa  231  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  81.29 
 
 
143 aa  229  7.000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  79.72 
 
 
143 aa  229  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  81.29 
 
 
143 aa  228  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  80.42 
 
 
143 aa  229  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  81.29 
 
 
143 aa  228  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  78.42 
 
 
143 aa  224  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  74.65 
 
 
143 aa  223  9e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  74.83 
 
 
142 aa  221  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  77.46 
 
 
144 aa  220  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  74.13 
 
 
142 aa  217  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3937  50S ribosomal protein L11  73.24 
 
 
143 aa  213  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4329  50S ribosomal protein L11  73.24 
 
 
143 aa  213  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  76.26 
 
 
143 aa  213  9e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  76.76 
 
 
144 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  71.83 
 
 
143 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  74.82 
 
 
143 aa  209  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  69.72 
 
 
143 aa  202  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  70.07 
 
 
141 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  67.83 
 
 
142 aa  201  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  68.12 
 
 
141 aa  201  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  68.12 
 
 
141 aa  201  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  70.07 
 
 
142 aa  200  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  67.13 
 
 
142 aa  199  7e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  70.8 
 
 
140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  72.46 
 
 
140 aa  198  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  66.67 
 
 
141 aa  196  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  68.61 
 
 
141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  68.84 
 
 
141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  71.01 
 
 
140 aa  194  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  71.01 
 
 
140 aa  194  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  69.57 
 
 
141 aa  194  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 
141 aa  192  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 
141 aa  192  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 
148 aa  192  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  68.61 
 
 
140 aa  190  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  67.15 
 
 
142 aa  189  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 
142 aa  188  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  66.67 
 
 
140 aa  188  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  66.67 
 
 
140 aa  188  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  68.84 
 
 
140 aa  188  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  68.35 
 
 
143 aa  187  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  187  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  187  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  187  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  187  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  187  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  187  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  66.91 
 
 
142 aa  187  5e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  187  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  187  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 
141 aa  187  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  187  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  187  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 
141 aa  187  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  63.77 
 
 
141 aa  187  5.999999999999999e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  65.94 
 
 
141 aa  186  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 
140 aa  186  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 
142 aa  186  9e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 
141 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  64.96 
 
 
141 aa  185  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  64.49 
 
 
144 aa  185  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  64.49 
 
 
146 aa  185  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  67.88 
 
 
141 aa  185  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  67.88 
 
 
141 aa  184  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209a  50S ribosomal protein L11  71.74 
 
 
143 aa  184  3e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113672 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  67.15 
 
 
141 aa  184  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  64.23 
 
 
142 aa  184  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1623  50S ribosomal protein L11  73.19 
 
 
143 aa  183  7e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.838498  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  63.04 
 
 
163 aa  183  8e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  63.77 
 
 
141 aa  183  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  63.77 
 
 
140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 
141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  61.31 
 
 
147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 
141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  60.87 
 
 
147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 
141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 
141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 
140 aa  181  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 
149 aa  181  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3864  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 
142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000881502  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 
140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 
143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>