More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29870 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  100 
 
 		 143 aa  289  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  91.61 
 
 		 143 aa  269  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  86.62 
 
 		 143 aa  256  9e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  87.32 
 
 		 143 aa  255  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  86.71 
 
 		 143 aa  254  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  87.23 
 
 		 143 aa  254  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  86.01 
 
 		 143 aa  253  7e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  86.01 
 
 		 143 aa  253  7e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  84.4 
 
 		 143 aa  246  9e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  80.14 
 
 		 143 aa  238  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  80.99 
 
 		 142 aa  235  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  80.99 
 
 		 142 aa  234  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  76.76 
 
 		 142 aa  233  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  79.58 
 
 		 142 aa  232  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  81.69 
 
 		 144 aa  231  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  79.58 
 
 		 142 aa  232  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  79.58 
 
 		 142 aa  230  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  79.72 
 
 		 143 aa  229  9e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  78.87 
 
 		 142 aa  228  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  76.6 
 
 		 144 aa  225  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  76.26 
 
 		 142 aa  224  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  76.39 
 
 		 144 aa  223  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5964  50S ribosomal protein L11  73.94 
 
 		 143 aa  221  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.666277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  74.83 
 
 		 143 aa  222  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  76.39 
 
 		 144 aa  221  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  73.24 
 
 		 142 aa  222  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  74.13 
 
 		 143 aa  221  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  73.94 
 
 		 144 aa  217  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 		 143 aa  216  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 		 143 aa  215  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3937  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 143 aa  210  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4329  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 143 aa  210  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  79.84 
 
 		 144 aa  209  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  66.9 
 
 		 142 aa  202  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  75.97 
 
 		 143 aa  202  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 142 aa  201  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  67.88 
 
 		 140 aa  196  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  67.63 
 
 		 141 aa  196  9e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 148 aa  194  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 141 aa  192  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  67.15 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  67.15 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 141 aa  190  5e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 		 140 aa  190  6e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 140 aa  189  8e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  63.31 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0993  50S ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000134652  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1623  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.838498  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 140 aa  187  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  68.57 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209a  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 143 aa  187  5e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113672 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  63.57 
 
 		 162 aa  186  7e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  67.39 
 
 		 140 aa  185  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  64.96 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 140 aa  184  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 142 aa  183  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 140 aa  183  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 140 aa  183  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  65.71 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002169  LSU ribosomal protein L11p (L12e)  64.29 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 141 aa  181  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00229  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 146 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 141 aa  180  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 140 aa  180  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 141 aa  180  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 140 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 141 aa  179  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 143 aa  179  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  65 
 
 		 143 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4773  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0832253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  65 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0473  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.015667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  65 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  65 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  65 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>