More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3173 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 147 aa  299  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  82.88 
 
 		 149 aa  260  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  82.31 
 
 		 147 aa  254  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  77.55 
 
 		 147 aa  244  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  80 
 
 		 145 aa  239  7.999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1706  ribosomal protein L11  76.87 
 
 		 147 aa  238  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0422  50S ribosomal protein L11  72.41 
 
 		 145 aa  225  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000957396  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00045  50S ribosomal protein L11  73.76 
 
 		 146 aa  225  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0390  50S ribosomal protein L11  72.92 
 
 		 145 aa  223  7e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1400  hypothetical protein  69.78 
 
 		 141 aa  208  2e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 141 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0486  50S ribosomal protein L11  68.31 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0527955  hitchhiker  0.00000142246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0315  50S ribosomal protein L11  68.31 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  65 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 140 aa  191  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 140 aa  190  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 146 aa  190  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 141 aa  189  8e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  61.97 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  60.71 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 141 aa  187  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0315  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000425279  hitchhiker  0.000807121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 141 aa  186  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 141 aa  186  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0192  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000446828  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 141 aa  186  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2683  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000789076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0169  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000273225  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 140 aa  184  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 		 141 aa  183  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 		 141 aa  183  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  61.15 
 
 		 140 aa  184  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  61.27 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1966  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 141 aa  183  8e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  58.57 
 
 		 141 aa  183  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  182  9e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5087  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0150529  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0229  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00138343  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  57.45 
 
 		 148 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  56.43 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  58.99 
 
 		 141 aa  180  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 140 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  60 
 
 		 141 aa  180  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  59.42 
 
 		 143 aa  180  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  56.12 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>