More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0192 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0192  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000446828  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  87.23 
 
 		 141 aa  257  4e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  85.11 
 
 		 141 aa  247  4e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0229  50S ribosomal protein L11  93.62 
 
 		 141 aa  247  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00138343  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1966  50S ribosomal protein L11  92.14 
 
 		 141 aa  244  4e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2683  50S ribosomal protein L11  88.57 
 
 		 141 aa  235  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000789076  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0315  50S ribosomal protein L11  86.43 
 
 		 141 aa  229  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000425279  hitchhiker  0.000807121 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  77.37 
 
 		 140 aa  218  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  72.34 
 
 		 141 aa  214  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 141 aa  213  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  72.26 
 
 		 140 aa  212  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 		 141 aa  211  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  72.14 
 
 		 140 aa  211  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 		 141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  72.14 
 
 		 140 aa  210  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  72.14 
 
 		 140 aa  209  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  71.43 
 
 		 140 aa  207  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  69.29 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 147 aa  203  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 141 aa  202  9e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 141 aa  202  9e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  70.71 
 
 		 140 aa  202  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  70 
 
 		 141 aa  201  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  70.92 
 
 		 143 aa  201  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  70.21 
 
 		 143 aa  201  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  67.88 
 
 		 140 aa  198  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  67.88 
 
 		 140 aa  198  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  67.88 
 
 		 141 aa  197  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1706  ribosomal protein L11  68.57 
 
 		 147 aa  196  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 141 aa  196  7.999999999999999e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 140 aa  195  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 143 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  66.2 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00045  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  69.06 
 
 		 145 aa  194  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  67.15 
 
 		 140 aa  194  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 141 aa  194  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 141 aa  193  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 143 aa  193  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 143 aa  193  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  64.03 
 
 		 143 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  66.42 
 
 		 140 aa  193  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 142 aa  193  6e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  193  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 141 aa  193  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 143 aa  192  9e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 143 aa  193  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 147 aa  192  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 142 aa  192  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 149 aa  192  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0394  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904146  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0042  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000150349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 147 aa  191  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 143 aa  191  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0173  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4701  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000419074  hitchhiker  0.00000427936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 142 aa  189  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 142 aa  189  9e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  59.57 
 
 		 141 aa  189  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>