More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1400 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_1400  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  285  1e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1706  ribosomal protein L11  67.86 
 
 
147 aa  209  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0216759  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  69.78 
 
 
147 aa  208  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  66.91 
 
 
147 aa  205  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 
149 aa  203  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00045  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
146 aa  194  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 
145 aa  193  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0845  ribosomal protein L11  61.87 
 
 
147 aa  193  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.518378 
 
 
-
 
NC_002950  PG0390  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 
145 aa  191  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0422  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 
145 aa  191  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000957396  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  56.03 
 
 
141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  59.29 
 
 
146 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 
140 aa  180  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0353  50S ribosomal protein L11  56.74 
 
 
141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000273622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  57.86 
 
 
140 aa  176  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  53.62 
 
 
143 aa  175  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  57.45 
 
 
141 aa  175  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  54.61 
 
 
141 aa  175  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 
140 aa  175  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 
141 aa  174  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  53.62 
 
 
142 aa  174  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  52.9 
 
 
142 aa  172  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 
141 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 
141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  56.12 
 
 
140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 
141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  52.17 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  55.32 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  54.61 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  56.59 
 
 
143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  52.17 
 
 
142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  57.45 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  57.45 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  52.17 
 
 
142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  52.17 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  56.83 
 
 
140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 
164 aa  170  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 
141 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 
141 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 
141 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 
141 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 
141 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 
141 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 
141 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 
141 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 
141 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 
141 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 
141 aa  170  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  56.83 
 
 
141 aa  170  6.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 
142 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  55.4 
 
 
140 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  54.35 
 
 
144 aa  169  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  55.32 
 
 
141 aa  169  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  55.32 
 
 
141 aa  169  9e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  54.68 
 
 
143 aa  169  9e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  55.8 
 
 
142 aa  169  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  55.32 
 
 
141 aa  168  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  56.83 
 
 
140 aa  168  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  53.96 
 
 
141 aa  168  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  56.83 
 
 
140 aa  168  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  55.32 
 
 
141 aa  169  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  53.62 
 
 
143 aa  168  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  52.9 
 
 
144 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0486  50S ribosomal protein L11  56.74 
 
 
142 aa  168  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0527955  hitchhiker  0.00000142246 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  53.62 
 
 
143 aa  168  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  55 
 
 
140 aa  167  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  52.52 
 
 
141 aa  167  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0315  50S ribosomal protein L11  56.74 
 
 
142 aa  168  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116049  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  53.62 
 
 
143 aa  168  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  55 
 
 
140 aa  168  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  55 
 
 
140 aa  167  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  51.77 
 
 
141 aa  167  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  53.19 
 
 
141 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2683  50S ribosomal protein L11  58.57 
 
 
141 aa  167  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000789076  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  54.29 
 
 
140 aa  167  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  52.17 
 
 
143 aa  167  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  54.29 
 
 
140 aa  167  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02801  50S ribosomal protein L11  53.19 
 
 
141 aa  167  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.219734  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  53.19 
 
 
141 aa  167  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  53.9 
 
 
141 aa  167  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  56.12 
 
 
140 aa  166  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  54.61 
 
 
141 aa  166  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  54.68 
 
 
144 aa  166  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  51.8 
 
 
143 aa  166  9e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  52.86 
 
 
140 aa  166  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  54.61 
 
 
141 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  54.61 
 
 
141 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  51.06 
 
 
141 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  56.74 
 
 
142 aa  166  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  53.57 
 
 
140 aa  166  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  50.71 
 
 
141 aa  165  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  53.24 
 
 
141 aa  165  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  54.35 
 
 
142 aa  165  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  52.17 
 
 
142 aa  165  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  52.52 
 
 
144 aa  165  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  51.08 
 
 
143 aa  165  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0315  50S ribosomal protein L11  57.86 
 
 
141 aa  165  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000425279  hitchhiker  0.000807121 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  56.49 
 
 
144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0192  50S ribosomal protein L11  57.45 
 
 
141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000446828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>