More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0445 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0445  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00177755  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1460  50S ribosomal protein L11  96.45 
 
 		 141 aa  274  3e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000504734  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0524  50S ribosomal protein L11  96.45 
 
 		 141 aa  274  3e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0672587  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0505  50S ribosomal protein L11  96.45 
 
 		 141 aa  274  3e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399461  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1320  50S ribosomal protein L11  92.91 
 
 		 141 aa  268  2e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800207  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0170  50S ribosomal protein L11  90.07 
 
 		 141 aa  261  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0415128  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0177  50S ribosomal protein L11  90.78 
 
 		 141 aa  261  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0566488  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1667  50S ribosomal protein L11  85.61 
 
 		 140 aa  250  5.000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00198224  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0349  ribosomal protein L11  81.56 
 
 		 141 aa  240  3.9999999999999997e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0127148  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0349  ribosomal protein L11  69.5 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00040646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 141 aa  183  7e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  65 
 
 		 141 aa  183  8e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3735  ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257354  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0506  50S ribosomal protein L11  65.22 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3889  ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 142 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0323173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  60.99 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  65 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 140 aa  178  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 141 aa  179  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3338  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3193  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.177211  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 141 aa  177  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  62.77 
 
 		 146 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2971  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.621539 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3318  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  64.29 
 
 		 143 aa  176  9e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3038  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0450649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  62.59 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  58.87 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  64.75 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  60.99 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0042  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000150349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  60.28 
 
 		 142 aa  174  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  61.31 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  174  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 143 aa  174  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  63.5 
 
 		 143 aa  174  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03859  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000538182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4012  ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000866586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4431  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000394212  hitchhiker  0.00000226734 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  59.57 
 
 		 141 aa  173  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4523  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000459439  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4481  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0148745  decreased coverage  0.00000000000000460315 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4359  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00156245  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4555  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.011622  hitchhiker  0.000000000000800119 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4471  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000366824  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5448  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000790923  hitchhiker  0.00174431 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03812  hypothetical protein  62.68 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000676745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4042  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000015229  hitchhiker  0.00267408 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4216  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.8656399999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0273  ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225698  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4391  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058803  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4478  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00436527  hitchhiker  0.00122683 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1045  ribosomal protein L11  60.43 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4535  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  173  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  58.16 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 140 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0755  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0193  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000186819  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  61.43 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2806  50S ribosomal protein L11  63.77 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221343  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  60.28 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  64.23 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  60.99 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>