More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1667 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1667  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 140 aa  280  7.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00198224  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0170  50S ribosomal protein L11  89.93 
 
 		 141 aa  254  3e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0415128  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0177  50S ribosomal protein L11  89.21 
 
 		 141 aa  253  4e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0566488  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0524  50S ribosomal protein L11  85.61 
 
 		 141 aa  251  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0672587  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0505  50S ribosomal protein L11  85.61 
 
 		 141 aa  251  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399461  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1460  50S ribosomal protein L11  85.61 
 
 		 141 aa  251  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000504734  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1320  50S ribosomal protein L11  85.61 
 
 		 141 aa  250  4.0000000000000004e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800207  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0445  50S ribosomal protein L11  85.61 
 
 		 141 aa  250  5.000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00177755  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0349  ribosomal protein L11  81.29 
 
 		 141 aa  236  1e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0127148  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0349  ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 141 aa  197  6e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00040646  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3038  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0450649 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2971  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 143 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.621539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3318  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 143 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 143 aa  193  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 143 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 143 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3193  50S ribosomal protein L11  68.79 
 
 		 143 aa  192  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.177211  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 143 aa  191  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 143 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 143 aa  191  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 143 aa  191  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 143 aa  191  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 143 aa  191  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3338  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 143 aa  191  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  66.43 
 
 		 140 aa  189  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0042  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000150349  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  67.38 
 
 		 143 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0506  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3735  ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257354  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 143 aa  187  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 141 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 143 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3889  ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 142 aa  187  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0323173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  68.35 
 
 		 140 aa  186  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  68.61 
 
 		 143 aa  185  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  66.91 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  66.67 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 140 aa  183  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4535  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 143 aa  183  5e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 140 aa  183  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  65.96 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 142 aa  183  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  66.67 
 
 		 143 aa  183  7e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 		 143 aa  183  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  68.84 
 
 		 143 aa  183  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 143 aa  182  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  66.19 
 
 		 140 aa  182  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0920  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000795353  hitchhiker  0.00000174139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3644  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416555 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  65.47 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2260  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44071  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3250  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3596  ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3901  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4446  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.258046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0394  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904146  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0755  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  67.39 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03859  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000538182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4012  ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000866586  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 143 aa  180  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4391  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5448  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000790923  hitchhiker  0.00174431 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4523  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000459439  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4216  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.8656399999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4555  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.011622  hitchhiker  0.000000000000800119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4431  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000394212  hitchhiker  0.00000226734 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4481  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0148745  decreased coverage  0.00000000000000460315 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03812  hypothetical protein  63.83 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000676745  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4359  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00156245  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4478  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00436527  hitchhiker  0.00122683 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4471  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000366824  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4042  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000015229  hitchhiker  0.00267408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0273  ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225698  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2806  50S ribosomal protein L11  64.54 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221343  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 141 aa  179  8.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  65.69 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  64.54 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0335  50S ribosomal protein L11  63.83 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00120454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>