More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0349 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0349  ribosomal protein L11  100 
 
 		 141 aa  283  8e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00040646  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0349  ribosomal protein L11  75.18 
 
 		 141 aa  220  7e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0127148  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0177  50S ribosomal protein L11  71.63 
 
 		 141 aa  210  7e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0566488  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0170  50S ribosomal protein L11  70.92 
 
 		 141 aa  209  7.999999999999999e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0415128  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0524  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 		 141 aa  207  3e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0672587  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0505  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 		 141 aa  207  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399461  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1460  50S ribosomal protein L11  70.21 
 
 		 141 aa  207  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000504734  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0445  50S ribosomal protein L11  69.5 
 
 		 141 aa  206  1e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00177755  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1320  50S ribosomal protein L11  68.09 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800207  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1667  50S ribosomal protein L11  67.63 
 
 		 140 aa  197  6e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00198224  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  64.03 
 
 		 143 aa  179  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0506  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 141 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 140 aa  176  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  60.28 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  62.04 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  174  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  60.28 
 
 		 141 aa  174  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 141 aa  173  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  60.99 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  59.57 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  62.32 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  57.45 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  60.99 
 
 		 141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  58.57 
 
 		 140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3871  ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  170  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0920  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 143 aa  170  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000795353  hitchhiker  0.00000174139 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 143 aa  170  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2971  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  169  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.621539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3318  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  169  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3735  ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  60 
 
 		 140 aa  169  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3038  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0450649 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  57.45 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4535  50S ribosomal protein L11  58.57 
 
 		 143 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  61.43 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 143 aa  169  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 145 aa  169  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3450  ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0033133  normal  0.0131963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3250  50S ribosomal protein L11  59.29 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  57.75 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3596  ribosomal protein L11  58.57 
 
 		 143 aa  167  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3901  50S ribosomal protein L11  59.29 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  60 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3338  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  167  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3193  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.177211  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  60 
 
 		 143 aa  167  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  58.16 
 
 		 141 aa  167  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3889  ribosomal protein L11  57.75 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0323173  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  57.75 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  57.55 
 
 		 143 aa  166  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 142 aa  166  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0755  50S ribosomal protein L11  59.29 
 
 		 143 aa  166  8e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  59.12 
 
 		 143 aa  166  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 143 aa  166  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  57.45 
 
 		 141 aa  166  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  56.03 
 
 		 141 aa  166  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 		 143 aa  166  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1045  ribosomal protein L11  59.71 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0315  50S ribosomal protein L11  58.57 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116049  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  58.16 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0486  50S ribosomal protein L11  58.57 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0527955  hitchhiker  0.00000142246 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3455  50S ribosomal protein L11P  60.87 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.270352 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  58.99 
 
 		 143 aa  166  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1706  ribosomal protein L11  56.83 
 
 		 147 aa  165  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0216759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0584  50S ribosomal protein L11  58.57 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  58.16 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0394  50S ribosomal protein L11  60 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904146  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  57.86 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2260  50S ribosomal protein L11  57.14 
 
 		 143 aa  165  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44071  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  56.74 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  56.83 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>