More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0302 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 145 aa  293  4e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  74.48 
 
 		 145 aa  235  1e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  65 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  64.08 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 		 141 aa  190  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  64.08 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  67.14 
 
 		 142 aa  190  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 143 aa  189  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  65 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  65 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0920  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000795353  hitchhiker  0.00000174139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  64.08 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  65 
 
 		 141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 141 aa  187  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  63.38 
 
 		 143 aa  187  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 141 aa  187  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  64.29 
 
 		 140 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  67.86 
 
 		 140 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 143 aa  187  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0229  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 141 aa  185  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0737159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2040  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000854354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  64.79 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5087  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0150529  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3201  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 142 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2277  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 142 aa  184  5e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 143 aa  184  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3450  ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 153 aa  184  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0033133  normal  0.0131963 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1891  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 143 aa  183  6e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0260  50S ribosomal protein L11  60.28 
 
 		 141 aa  183  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2806  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221343  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1823  50S ribosomal protein L11  57.04 
 
 		 142 aa  183  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 142 aa  183  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2181  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.296163  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3692  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1248  50S ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3864  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000881502  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  62.68 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1209  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0836  50S ribosomal protein L11P  60.99 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00174211  normal  0.0898369 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0335  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00120454  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2870  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000138901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0312  ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 143 aa  180  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000294677  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 141 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 144 aa  180  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0506  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3472  50S ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0169  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000273225  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3455  50S ribosomal protein L11P  59.86 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.270352 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2971  50S ribosomal protein L11  60.84 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.621539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3318  50S ribosomal protein L11  60.84 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 		 141 aa  180  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0383  50S ribosomal protein L11  65.97 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0358  50S ribosomal protein L11  65.97 
 
 		 144 aa  180  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002169  LSU ribosomal protein L11p (L12e)  61.97 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 143 aa  180  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4773  50S ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 142 aa  180  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0832253  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  60.71 
 
 		 141 aa  180  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  65.25 
 
 		 141 aa  180  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0273  ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 142 aa  179  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225698  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  61.59 
 
 		 143 aa  179  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3038  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 143 aa  179  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0450649 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 140 aa  179  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0745  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00286512  normal  0.949117 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00229  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0193  50S ribosomal protein L11  62.41 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000186819  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06120  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  61.43 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3735  ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>