More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0254 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 145 aa  293  5e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  74.48 
 
 		 145 aa  235  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 143 aa  190  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0920  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 143 aa  189  8e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000795353  hitchhiker  0.00000174139 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 141 aa  189  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  61.27 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 141 aa  189  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  62.68 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 141 aa  187  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 143 aa  186  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 143 aa  186  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 143 aa  186  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 143 aa  186  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 143 aa  186  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 143 aa  186  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 143 aa  186  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  63.38 
 
 		 143 aa  186  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  63.12 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  61.7 
 
 		 140 aa  186  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  62.68 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3455  50S ribosomal protein L11P  59.86 
 
 		 143 aa  185  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.270352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2040  50S ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000854354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 143 aa  183  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 143 aa  183  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  64.49 
 
 		 143 aa  182  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 143 aa  182  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 143 aa  182  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0506  50S ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 143 aa  182  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 143 aa  182  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  61.97 
 
 		 143 aa  182  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3038  50S ribosomal protein L11  60.84 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0450649 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  59.44 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  59.57 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3871  ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2971  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.621539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1823  50S ribosomal protein L11  57.04 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3318  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0394  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904146  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0042  50S ribosomal protein L11  59.44 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000150349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4446  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 		 144 aa  181  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.258046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0229  50S ribosomal protein L11  58.87 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0737159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3450  ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 153 aa  181  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0033133  normal  0.0131963 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 		 144 aa  181  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3201  50S ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 142 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0260  50S ribosomal protein L11  57.45 
 
 		 141 aa  180  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2277  50S ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 142 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 143 aa  179  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  57.14 
 
 		 141 aa  179  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0755  50S ribosomal protein L11  59.86 
 
 		 143 aa  179  9.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3644  50S ribosomal protein L11  60.56 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  60.28 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3193  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.177211  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3596  ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0312  ribosomal protein L11  56.34 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000294677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  60 
 
 		 141 aa  179  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  60 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4535  50S ribosomal protein L11  58.04 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.438276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  58.87 
 
 		 140 aa  179  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  57.86 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3338  50S ribosomal protein L11  59.44 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5087  50S ribosomal protein L11  57.75 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0150529  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0584  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  60 
 
 		 140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  58.16 
 
 		 140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  56.74 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06120  50S ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  56.74 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  65 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3901  50S ribosomal protein L11  57.34 
 
 		 143 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  60 
 
 		 140 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  57.86 
 
 		 141 aa  177  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3250  50S ribosomal protein L11  57.34 
 
 		 143 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2870  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000138901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  55.32 
 
 		 141 aa  176  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1891  50S ribosomal protein L11  56.34 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2260  50S ribosomal protein L11  57.34 
 
 		 143 aa  176  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44071  normal  0.728931 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0335  50S ribosomal protein L11  57.75 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00120454  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  56.34 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  59.29 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  57.14 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  57.45 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3692  50S ribosomal protein L11  57.75 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3920  50S ribosomal protein L11  58.45 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  58.16 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  60 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>