More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2870 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2870  50S ribosomal protein L11  100 
 
 
142 aa  287  3e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000138901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002169  LSU ribosomal protein L11p (L12e)  95.07 
 
 
142 aa  279  7.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00229  50S ribosomal protein L11  94.37 
 
 
142 aa  278  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2726  50S ribosomal protein L11  90.14 
 
 
142 aa  264  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  86.52 
 
 
142 aa  258  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  86.52 
 
 
142 aa  257  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0193  50S ribosomal protein L11  85.82 
 
 
142 aa  256  7e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000186819  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2806  50S ribosomal protein L11  85.21 
 
 
142 aa  254  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221343  normal  0.107849 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03859  50S ribosomal protein L11  84.4 
 
 
142 aa  253  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000538182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4012  ribosomal protein L11  84.4 
 
 
142 aa  253  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000866586  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4478  50S ribosomal protein L11  84.4 
 
 
142 aa  253  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00436527  hitchhiker  0.00122683 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4431  50S ribosomal protein L11  84.4 
 
 
142 aa  253  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000394212  hitchhiker  0.00000226734 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4471  50S ribosomal protein L11  84.4 
 
 
142 aa  253  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000366824  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4042  50S ribosomal protein L11  84.4 
 
 
142 aa  253  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000015229  hitchhiker  0.00267408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4359  50S ribosomal protein L11  84.4 
 
 
142 aa  253  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00156245  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4481  50S ribosomal protein L11  84.4 
 
 
142 aa  253  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0148745  decreased coverage  0.00000000000000460315 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03812  hypothetical protein  84.4 
 
 
142 aa  253  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000676745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5448  50S ribosomal protein L11  84.4 
 
 
142 aa  253  5e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000790923  hitchhiker  0.00174431 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4391  50S ribosomal protein L11  84.4 
 
 
142 aa  253  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4216  50S ribosomal protein L11  84.4 
 
 
142 aa  253  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.8656399999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4523  50S ribosomal protein L11  84.4 
 
 
142 aa  253  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000459439  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4555  50S ribosomal protein L11  84.4 
 
 
142 aa  253  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.011622  hitchhiker  0.000000000000800119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0273  ribosomal protein L11  85.11 
 
 
142 aa  253  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225698  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3735  ribosomal protein L11  85.11 
 
 
142 aa  253  8e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0335  50S ribosomal protein L11  84.51 
 
 
142 aa  252  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00120454  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3864  50S ribosomal protein L11  84.51 
 
 
142 aa  252  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000881502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3889  ribosomal protein L11  83.69 
 
 
142 aa  249  7e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0323173  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0169  50S ribosomal protein L11  83.8 
 
 
142 aa  246  7e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000273225  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0173  50S ribosomal protein L11  83.69 
 
 
142 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4701  50S ribosomal protein L11  83.69 
 
 
142 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000419074  hitchhiker  0.00000427936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0137  50S ribosomal protein L11  82.98 
 
 
142 aa  240  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000238493  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0147  50S ribosomal protein L11  82.98 
 
 
142 aa  240  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000977469  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4328  50S ribosomal protein L11  82.27 
 
 
142 aa  239  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000353515  hitchhiker  0.00000000170841 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0202  50S ribosomal protein L11  80.14 
 
 
142 aa  237  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000393914  hitchhiker  0.0000945283 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3770  50S ribosomal protein L11  81.56 
 
 
142 aa  237  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000004485  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  80.28 
 
 
143 aa  236  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0220  50S ribosomal protein L11  80.28 
 
 
142 aa  236  6.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0188  50S ribosomal protein L11  80.28 
 
 
142 aa  236  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000110697  hitchhiker  0.00720013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0183  50S ribosomal protein L11  80.28 
 
 
142 aa  236  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  0.0105542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0188  50S ribosomal protein L11  80.28 
 
 
142 aa  236  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00929078 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  79.58 
 
 
143 aa  234  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3450  ribosomal protein L11  78.17 
 
 
153 aa  232  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0033133  normal  0.0131963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4067  50S ribosomal protein L11  79.43 
 
 
142 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000738162  hitchhiker  0.00970321 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4471  50S ribosomal protein L11  79.43 
 
 
142 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0185  50S ribosomal protein L11  79.43 
 
 
142 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166611  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0189  50S ribosomal protein L11  79.43 
 
 
142 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000123939  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0159  50S ribosomal protein L11  78.72 
 
 
142 aa  230  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000114645  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4773  50S ribosomal protein L11  78.01 
 
 
142 aa  230  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0832253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0826  50S ribosomal protein L11  76.76 
 
 
143 aa  228  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08720  50S ribosomal protein L11  76.76 
 
 
143 aa  228  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444282  hitchhiker  0.00204472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  76.76 
 
 
143 aa  228  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  75.35 
 
 
143 aa  227  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06120  50S ribosomal protein L11  75.35 
 
 
143 aa  226  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3920  50S ribosomal protein L11  75.35 
 
 
143 aa  225  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848211  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  75.35 
 
 
142 aa  225  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0498  ribosomal protein L11  75.35 
 
 
142 aa  224  2e-58  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  76.06 
 
 
148 aa  224  4e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5090  50S ribosomal protein L11  75.35 
 
 
143 aa  224  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000105007  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  74.65 
 
 
143 aa  223  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0443  50S ribosomal protein L11  74.65 
 
 
143 aa  223  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273232  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0473  50S ribosomal protein L11  74.65 
 
 
143 aa  223  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.015667  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  74.65 
 
 
143 aa  223  7e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4760  50S ribosomal protein L11  74.65 
 
 
143 aa  223  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000974914  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0476  50S ribosomal protein L11  74.65 
 
 
143 aa  223  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000067383  normal  0.0123717 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  73.24 
 
 
143 aa  222  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4287  50S ribosomal protein L11  74.65 
 
 
144 aa  222  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000848232  hitchhiker  0.000000453889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0615  ribosomal protein L11  74.65 
 
 
143 aa  221  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.956774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4559  50S ribosomal protein L11  74.65 
 
 
143 aa  221  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275981  normal  0.0500923 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  73.24 
 
 
143 aa  216  7e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0920  50S ribosomal protein L11  73.94 
 
 
143 aa  215  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000795353  hitchhiker  0.00000174139 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04534  50S ribosomal protein L11  70.42 
 
 
142 aa  214  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2200  50S ribosomal protein L11  71.13 
 
 
169 aa  213  5e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723697  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2111  50S ribosomal protein L11  69.72 
 
 
169 aa  213  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000939777  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  73.24 
 
 
142 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0745  50S ribosomal protein L11  70.42 
 
 
142 aa  210  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00286512  normal  0.949117 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  67.61 
 
 
143 aa  209  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0486  50S ribosomal protein L11  69.01 
 
 
142 aa  206  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0527955  hitchhiker  0.00000142246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0315  50S ribosomal protein L11  69.01 
 
 
142 aa  206  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116049  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0383  50S ribosomal protein L11  74.65 
 
 
144 aa  205  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0358  50S ribosomal protein L11  74.65 
 
 
144 aa  205  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0394  50S ribosomal protein L11  66.9 
 
 
143 aa  205  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904146  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  64.79 
 
 
143 aa  205  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0268  50S ribosomal protein L11P  66.9 
 
 
143 aa  202  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00815832  hitchhiker  0.0013988 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0323  50S ribosomal protein L11  67.13 
 
 
145 aa  202  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00428348  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1866  50S ribosomal protein L11  66.43 
 
 
145 aa  202  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000205229  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3038  50S ribosomal protein L11  64.79 
 
 
143 aa  201  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0450649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 
143 aa  201  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0312  ribosomal protein L11  67.61 
 
 
143 aa  202  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000294677  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2971  50S ribosomal protein L11  64.08 
 
 
143 aa  201  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.621539 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2040  50S ribosomal protein L11  67.61 
 
 
143 aa  201  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000854354  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3318  50S ribosomal protein L11  64.08 
 
 
143 aa  201  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586189  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1910  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 
143 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000051235  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2645  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 
143 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0183792  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 
143 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3080  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 
143 aa  201  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3820  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 
143 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3758  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 
143 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00142247  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3465  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 
143 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108139  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3182  50S ribosomal protein L11  65.49 
 
 
143 aa  201  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000133089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3656  50S ribosomal protein L11  64.08 
 
 
143 aa  200  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00490061  hitchhiker  0.000000708999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>