More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1045 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1045  ribosomal protein L11  100 
 
 
142 aa  283  4e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0104784  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
140 aa  191  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
140 aa  191  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  65.71 
 
 
140 aa  191  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 
141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 
141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
141 aa  186  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
141 aa  186  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
141 aa  186  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
141 aa  186  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
141 aa  186  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
141 aa  186  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
141 aa  186  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
141 aa  186  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
141 aa  186  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
141 aa  186  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  62.86 
 
 
141 aa  186  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  63.31 
 
 
141 aa  184  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  62.24 
 
 
143 aa  182  9e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  61.15 
 
 
141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  59.71 
 
 
141 aa  181  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  61.15 
 
 
143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 
143 aa  180  6e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  62.94 
 
 
143 aa  180  6e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  58.39 
 
 
143 aa  179  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  63.64 
 
 
143 aa  179  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 
141 aa  178  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 
143 aa  178  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  62.68 
 
 
142 aa  178  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 
143 aa  178  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 
141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  61.27 
 
 
142 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 
143 aa  177  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00045  50S ribosomal protein L11  59.57 
 
 
146 aa  177  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  61.54 
 
 
143 aa  177  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 
141 aa  176  5.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 
141 aa  176  8e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0349  ribosomal protein L11  63.31 
 
 
141 aa  176  8e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0127148  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0312  ribosomal protein L11  60.84 
 
 
143 aa  176  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000294677  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  61.54 
 
 
143 aa  175  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  60 
 
 
140 aa  176  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 
164 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 
141 aa  174  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  60.28 
 
 
141 aa  175  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 
140 aa  175  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  63.57 
 
 
140 aa  175  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0524  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 
141 aa  174  3e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0672587  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 
140 aa  174  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0505  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 
141 aa  174  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399461  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1460  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 
141 aa  174  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000504734  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  57.97 
 
 
142 aa  174  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  58.99 
 
 
141 aa  174  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3161  ribosomal protein L11  59.12 
 
 
143 aa  174  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.236872  normal  0.189957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 
148 aa  174  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0911  ribosomal protein L11  59.85 
 
 
144 aa  174  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614786  normal  0.237922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  60.43 
 
 
141 aa  174  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  60.58 
 
 
143 aa  174  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  60.84 
 
 
143 aa  174  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0177  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 
141 aa  173  6e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0566488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  58.57 
 
 
141 aa  173  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0445  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 
141 aa  173  7e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00177755  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6061  50S ribosomal protein L11  60.58 
 
 
144 aa  173  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  57.86 
 
 
141 aa  173  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  58.16 
 
 
146 aa  173  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1667  50S ribosomal protein L11  62.14 
 
 
140 aa  173  8e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00198224  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  58.87 
 
 
145 aa  173  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1320  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 
141 aa  172  9e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000800207  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1062  ribosomal protein L11  61.54 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0402568  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1891  50S ribosomal protein L11  62.24 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  58.57 
 
 
141 aa  172  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0170  50S ribosomal protein L11  61.87 
 
 
141 aa  172  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0415128  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  57.14 
 
 
141 aa  172  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 
141 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  58.27 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0884  50S ribosomal protein L11  58.57 
 
 
140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0329341  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 
141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  56.43 
 
 
141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  56.43 
 
 
141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0615  50S ribosomal protein L11  61.15 
 
 
140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186897 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  63.04 
 
 
140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  57.55 
 
 
141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  58.7 
 
 
143 aa  171  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2181  50S ribosomal protein L11  61.54 
 
 
143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.296163  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 
141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 
140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2040  50S ribosomal protein L11  61.54 
 
 
143 aa  171  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000854354  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  58.27 
 
 
140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  61.43 
 
 
140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  59.71 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 
140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  59.15 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  58.57 
 
 
141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0612  ribosomal protein L11  57.97 
 
 
143 aa  170  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4773  50S ribosomal protein L11  61.7 
 
 
142 aa  170  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0832253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1335  50S ribosomal protein L11  60.43 
 
 
141 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183165  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0383  50S ribosomal protein L11  65.03 
 
 
144 aa  169  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0358  50S ribosomal protein L11  65.03 
 
 
144 aa  169  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  59.42 
 
 
142 aa  169  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_865  ribosomal protein L11  57.86 
 
 
140 aa  169  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00772592  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  59.42 
 
 
142 aa  169  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>