More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1582 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  100 
 
 		 157 aa  307  2.9999999999999997e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  76.28 
 
 		 158 aa  246  7e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  78.43 
 
 		 158 aa  240  3.9999999999999997e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  72.44 
 
 		 158 aa  228  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  71.15 
 
 		 158 aa  225  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  58.6 
 
 		 161 aa  191  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  58.23 
 
 		 159 aa  181  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  58.23 
 
 		 159 aa  181  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  58.23 
 
 		 159 aa  181  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  57.59 
 
 		 159 aa  181  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  55.77 
 
 		 161 aa  180  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  56.13 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  54.14 
 
 		 157 aa  168  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  55.92 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  51.92 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  51.28 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  50.64 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  50.32 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  51.92 
 
 		 162 aa  163  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  50 
 
 		 159 aa  157  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  52.9 
 
 		 168 aa  134  4e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  45.51 
 
 		 170 aa  134  7.000000000000001e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  41.29 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  38.93 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  41.22 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  38.69 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  40.14 
 
 		 146 aa  104  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  38.93 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  37.96 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  37.88 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  37.88 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  38.64 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  37.12 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  37.88 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  38.69 
 
 		 143 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  37.12 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  37.12 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  34.81 
 
 		 140 aa  99.4  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3288  ribosomal protein L11  35.88 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0476152  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  37.4 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  37.4 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  40.29 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  39.69 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  39.39 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  41.01 
 
 		 141 aa  99  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  35.61 
 
 		 141 aa  99  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 141 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  35.82 
 
 		 141 aa  97.8  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  37.12 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  36.23 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  37.88 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  36.5 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  37.04 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  36.3 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  37.4 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  34.33 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  36.64 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  37.04 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  37.23 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  34.35 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1966  50S ribosomal protein L11  40.68 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  38.06 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1891  50S ribosomal protein L11  38.06 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2181  50S ribosomal protein L11  38.06 
 
 		 143 aa  94.4  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.296163  normal  0.0253858 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0676  ribosomal protein L11  36.64 
 
 		 143 aa  94.4  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.900639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  37.12 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  37.31 
 
 		 143 aa  94  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 141 aa  94  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  35.04 
 
 		 148 aa  94  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  35.61 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  36.64 
 
 		 141 aa  93.6  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  35.61 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0192  50S ribosomal protein L11  41.88 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000446828  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  35.61 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  36.84 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  37.31 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  33.59 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1954  ribosomal protein L11  39.39 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0370105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  37.04 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0173  50S ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4701  50S ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000419074  hitchhiker  0.00000427936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0137  50S ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 142 aa  92  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000238493  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21020  LSU ribosomal protein L11P  36.5 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.116118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  35.07 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  32.82 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  35.07 
 
 		 143 aa  91.7  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  34.51 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  34.85 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2425  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 		 143 aa  91.3  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0323848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  34.85 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  34.85 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  34.85 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  33.59 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  34.85 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  34.85 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>