More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1422 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  100 
 
 		 159 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  54.49 
 
 		 161 aa  179  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  55.62 
 
 		 161 aa  178  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  55.48 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  55.48 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  54.19 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  54.49 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  53.55 
 
 		 159 aa  167  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  53.25 
 
 		 160 aa  168  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  51.27 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  56 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  51.27 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  51.92 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  51.3 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  50 
 
 		 157 aa  157  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  48.08 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  47.13 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  45.51 
 
 		 157 aa  147  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  45.51 
 
 		 162 aa  147  8e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  44.23 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  51.35 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  44.44 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  43.33 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  40.58 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  38.69 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  42.97 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0439  ribosomal protein L11  41.22 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  39.26 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  39.39 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  41.48 
 
 		 140 aa  97.1  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  43.17 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  39.72 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  40 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  41.67 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  36.76 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  43.18 
 
 		 141 aa  95.5  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  37.23 
 
 		 144 aa  95.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  40.29 
 
 		 142 aa  94.7  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  37.04 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  39.37 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  39.85 
 
 		 141 aa  94.7  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  36.5 
 
 		 144 aa  94  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  38.28 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  39.85 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0521  ribosomal protein L11  40.15 
 
 		 144 aa  93.6  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  40.91 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  36.5 
 
 		 141 aa  93.6  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  40.16 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  40.91 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  40.15 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  40.94 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  38.28 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  39.06 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  40.91 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  38.28 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  38.46 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1602  50S ribosomal protein L11P  34.19 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.951942 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  38.28 
 
 		 142 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  40.29 
 
 		 141 aa  91.7  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  40.91 
 
 		 141 aa  91.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  39.37 
 
 		 140 aa  91.7  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  40.91 
 
 		 141 aa  91.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  38.28 
 
 		 142 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  36.57 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  40.46 
 
 		 142 aa  91.3  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  39.84 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  38.28 
 
 		 142 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  39.06 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  37.78 
 
 		 142 aa  90.9  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  40.16 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  37.88 
 
 		 141 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  40.29 
 
 		 142 aa  90.5  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  37.88 
 
 		 141 aa  90.5  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0464  50S ribosomal protein L11P  33.12 
 
 		 167 aa  90.5  8e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  38.46 
 
 		 143 aa  90.5  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  40.15 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3288  ribosomal protein L11  35.61 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0476152  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  36.03 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  38.93 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  38.06 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  38.64 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  36.5 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  39.37 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  39.57 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  38.35 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  39.85 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  39.2 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  39.2 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  38.17 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  37.8 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  35.56 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02801  50S ribosomal protein L11  40.29 
 
 		 141 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.219734  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 		 140 aa  89  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  40.29 
 
 		 141 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  39.39 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  39.55 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  38.35 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>