More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0385 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  100 
 
 		 159 aa  313  8e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  53.8 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  52.53 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  51.27 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  51.27 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  50.32 
 
 		 157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  51.32 
 
 		 158 aa  160  8.000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  51.3 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  47.17 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  51.66 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  52.11 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  51.33 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  50.33 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  46.79 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  50 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  46.1 
 
 		 168 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  43.05 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  42.14 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  43.71 
 
 		 162 aa  134  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  43.05 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  41.72 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  42.38 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  40.4 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  42.31 
 
 		 144 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  39.55 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  39.01 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  41.86 
 
 		 143 aa  97.1  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0173  50S ribosomal protein L11  40 
 
 		 142 aa  96.3  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4701  50S ribosomal protein L11  40 
 
 		 142 aa  96.3  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000419074  hitchhiker  0.00000427936 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0147  50S ribosomal protein L11  39.23 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000977469  normal  0.034689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4328  50S ribosomal protein L11  39.23 
 
 		 142 aa  95.5  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000353515  hitchhiker  0.00000000170841 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  41.98 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  35.57 
 
 		 163 aa  94.4  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0439  ribosomal protein L11  37.5 
 
 		 144 aa  94.4  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  40 
 
 		 144 aa  94  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  39.85 
 
 		 143 aa  94.4  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1400  hypothetical protein  40.31 
 
 		 141 aa  93.6  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  39.86 
 
 		 143 aa  93.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  41.98 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  39.86 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0498  ribosomal protein L11  38.17 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0137  50S ribosomal protein L11  37.23 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000238493  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  35.42 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  39.42 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  39.13 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  41.22 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  38.81 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2676  ribosomal protein L11  40.77 
 
 		 143 aa  91.7  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  37.04 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  40 
 
 		 143 aa  90.5  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  39.53 
 
 		 141 aa  90.5  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 141 aa  90.5  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0708  50S ribosomal protein L11  39.13 
 
 		 143 aa  90.5  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0465712  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4773  50S ribosomal protein L11  41.54 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0832253  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  39.53 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  37.31 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  39.53 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  37.04 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  39.2 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  40.77 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1806  50S ribosomal protein L11  39.53 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.785581  normal  0.199785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  40.43 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  40.77 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  39.53 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002169  LSU ribosomal protein L11p (L12e)  39.13 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  38.35 
 
 		 141 aa  89.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0349  ribosomal protein L11  37.23 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00040646  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0486  50S ribosomal protein L11  38.17 
 
 		 142 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0527955  hitchhiker  0.00000142246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0315  50S ribosomal protein L11  38.17 
 
 		 142 aa  89.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.116049  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  39.69 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  39.53 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  38.1 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4524  ribosomal protein L11  37.98 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  36.96 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00229  50S ribosomal protein L11  38.41 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0169  50S ribosomal protein L11  38.17 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000273225  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  37.98 
 
 		 143 aa  89  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 142 aa  89  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0594  ribosomal protein L11  40.46 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000269533  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2806  50S ribosomal protein L11  40.46 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221343  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  39.1 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3735  ribosomal protein L11  39.23 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257354  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  37.21 
 
 		 142 aa  88.2  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0201  50S ribosomal protein L11  40.77 
 
 		 142 aa  87.8  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0265653  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3288  ribosomal protein L11  32.58 
 
 		 141 aa  87.8  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0476152  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  35.07 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  40 
 
 		 141 aa  87.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0206  50S ribosomal protein L11  40.77 
 
 		 142 aa  87.4  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000183959  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  38.76 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3864  50S ribosomal protein L11  40.46 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000881502  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0335  50S ribosomal protein L11  40.46 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00120454  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2726  50S ribosomal protein L11  37.4 
 
 		 142 aa  87  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000093206  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3889  ribosomal protein L11  38.46 
 
 		 142 aa  87  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0323173  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 140 aa  87  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0922  50S ribosomal protein L11  39.84 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3339  50S ribosomal protein L11  39.84 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131988 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  38.17 
 
 		 143 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  38.89 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  34.09 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  37.5 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>