More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0162 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  100 
 
 		 158 aa  306  6.999999999999999e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  79.75 
 
 		 158 aa  257  4e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  78.21 
 
 		 158 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  78.21 
 
 		 158 aa  251  3e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  76.28 
 
 		 157 aa  246  7e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  56.33 
 
 		 161 aa  189  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  57.05 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  56.13 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  57.59 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  58.23 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  57.59 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  56.33 
 
 		 159 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  55.92 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  51.27 
 
 		 159 aa  167  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  51.92 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  48.08 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  50.64 
 
 		 157 aa  164  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  49.36 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  49.68 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  46.79 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  50.66 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  43.23 
 
 		 170 aa  130  7.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  40.13 
 
 		 168 aa  117  6e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  37.5 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  36.64 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  38.97 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  36.64 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  38.93 
 
 		 141 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  39.69 
 
 		 141 aa  98.2  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  38.17 
 
 		 140 aa  97.4  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  39.44 
 
 		 146 aa  97.4  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4320  50S ribosomal protein L11  37.4 
 
 		 141 aa  97.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  37.59 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  39.57 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  36.64 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  38.81 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  35.88 
 
 		 141 aa  95.5  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  39.57 
 
 		 141 aa  95.1  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  37.68 
 
 		 147 aa  94.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  36.64 
 
 		 140 aa  94.7  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  36.09 
 
 		 144 aa  94.4  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  35.61 
 
 		 141 aa  94.4  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2726  50S ribosomal protein L11  36.64 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000920277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2412  50S ribosomal protein L11  36.64 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000128335  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  36.36 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  37.4 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  35.07 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  35.88 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  35.11 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  35.61 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  35.88 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09660  LSU ribosomal protein L11P  36.36 
 
 		 163 aa  91.7  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0814803  hitchhiker  0.0000862042 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  34.07 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  34.85 
 
 		 140 aa  91.7  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  37.4 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  34.85 
 
 		 141 aa  91.3  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08700  LSU ribosomal protein L11P  35.51 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0198308  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0284  50S ribosomal protein L11  36.36 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380764  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0295  50S ribosomal protein L11P  38.17 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.607095 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  35.11 
 
 		 141 aa  90.9  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  33.58 
 
 		 141 aa  90.9  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0676  ribosomal protein L11  31.68 
 
 		 169 aa  90.9  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  34.59 
 
 		 141 aa  90.9  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2785  ribosomal protein L11  34.85 
 
 		 140 aa  90.9  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000321602  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  37.68 
 
 		 143 aa  90.9  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  33.58 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  33.57 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  33.59 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1832  50S ribosomal protein L11P  35.06 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0439  ribosomal protein L11  36.64 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  34.78 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  35.11 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  36.3 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  33.58 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  35.56 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2724  ribosomal protein L11  37.5 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.239254  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  34.07 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  35.88 
 
 		 141 aa  89.7  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3349  ribosomal protein L11  37.31 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.533999  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  35.34 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2971  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.621539 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  35.88 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3318  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3288  ribosomal protein L11  31.3 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0476152  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1602  50S ribosomal protein L11P  32.03 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.951942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3596  ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  34.85 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  37.31 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2867  50S ribosomal protein L11  38.93 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.66773  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3038  50S ribosomal protein L11  35.82 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0450649 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  34.09 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  34.09 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0038  50S ribosomal protein L11  34.33 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000123599  hitchhiker  0.0000000000171978 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  34.33 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  35.34 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1323  ribosomal protein L11  36.8 
 
 		 140 aa  87.4  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1400  hypothetical protein  35.88 
 
 		 141 aa  87.4  7e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  34.09 
 
 		 141 aa  87  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  35.11 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4446  50S ribosomal protein L11  36.57 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.258046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>