128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1602 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1602  50S ribosomal protein L11P  100 
 
 		 165 aa  330  6e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.951942 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0464  50S ribosomal protein L11P  83.03 
 
 		 167 aa  289  1e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1656  50S ribosomal protein L11P  78.79 
 
 		 167 aa  276  1e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1832  50S ribosomal protein L11P  78.18 
 
 		 166 aa  261  4e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0676  ribosomal protein L11  39.39 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  39.76 
 
 		 170 aa  118  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  36.75 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  33.75 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  32.7 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  32.7 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  32.72 
 
 		 159 aa  94.4  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  34.38 
 
 		 160 aa  94.4  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  34.19 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  35.9 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  32.9 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  32.03 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  35.48 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  31.82 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  33.55 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  33.1 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  29.41 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  31.1 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  26.92 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  27.21 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  27.52 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  27.52 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  28.19 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  24.5 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  28.57 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  25.9 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03640  LSU ribosomal protein L11P  27.69 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  28.57 
 
 		 141 aa  51.6  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  29.41 
 
 		 141 aa  51.6  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  25.93 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  27.86 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  27.86 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  27.89 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0269  50S ribosomal protein L11  29.07 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000260628  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_13461  Plastid ribosomal protein L11 large ribosomal subunit  28.03 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0579369  normal  0.218003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0742  ribosomal protein L11  29.41 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1476  50S ribosomal protein L11  24.11 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0498135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1014  ribosomal protein L11  30.95 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1571  50S ribosomal protein L11  27.86 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  23.85 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02801  50S ribosomal protein L11  27.86 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.219734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1112  ribosomal protein L11  25.74 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  23.57 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1235  50S ribosomal protein L11  25.38 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308607 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  27.66 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  28.37 
 
 		 141 aa  47.8  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  30.23 
 
 		 144 aa  47.4  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  26.03 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02221  50S ribosomal protein L11  26.43 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0733022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0387  ribosomal protein L11  28.57 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  25.66 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5116  50S ribosomal protein L11  25.38 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0395  50S ribosomal protein L11  26.4 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00763778  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0923  50S ribosomal protein L11  25.38 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0940  50S ribosomal protein L11  25.38 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0951  50S ribosomal protein L11  25.38 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10653  50S ribosomal protein L11  28.24 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253785 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  22.22 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  27.86 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  26.03 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0521  ribosomal protein L11  29.41 
 
 		 144 aa  45.4  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  27.13 
 
 		 141 aa  45.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf144  50S ribosomal protein L11  25.22 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34409  Ribosomal protein L12, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  24.66 
 
 		 166 aa  44.7  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.355279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  25.35 
 
 		 141 aa  44.3  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  26.03 
 
 		 141 aa  44.7  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  23.24 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17290  50S ribosomal protein L11  29.07 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0576  ribosomal protein L11  29.76 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.511345  normal  0.0123947 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  26.24 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1419  50S ribosomal protein L11P  30.86 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000108032  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2994  50S ribosomal protein L11  26.72 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0869  ribosomal protein L11  25 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  29.76 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28979  predicted protein  21.25 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.865552  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  25.53 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2706  50S ribosomal protein L11  26.72 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244703 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06990  conserved hypothetical protein  23.23 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.845864  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  30.95 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  24.09 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  25 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  27.38 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1866  50S ribosomal protein L11  24.14 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000205229  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0122  ribosomal protein L11  25.53 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0302  50S ribosomal protein L11  21.53 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000139433  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  21.54 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  29.55 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0323  50S ribosomal protein L11  24.14 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00428348  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29870  LSU ribosomal protein L11P  25.19 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.987247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  29.63 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  39.62 
 
 		 147 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0569  50S ribosomal protein L11  29.89 
 
 		 144 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0498  ribosomal protein L11  26.74 
 
 		 142 aa  42  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  28.74 
 
 		 140 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  32.84 
 
 		 140 aa  42  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0439  ribosomal protein L11  24.24 
 
 		 144 aa  42  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>